More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3054 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  100 
 
 
388 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  59.07 
 
 
395 aa  348  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
424 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  38.61 
 
 
420 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
417 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  36.92 
 
 
424 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  35.65 
 
 
375 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  36.43 
 
 
393 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.17 
 
 
415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
401 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
469 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
418 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
413 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
424 aa  136  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  35.26 
 
 
371 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.97 
 
 
408 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  41.96 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  37.08 
 
 
425 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  35.58 
 
 
445 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.61 
 
 
379 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.66 
 
 
398 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
386 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
373 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  37.2 
 
 
445 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.38 
 
 
389 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.17 
 
 
371 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
394 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.54 
 
 
430 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.58 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.43 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.33 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  32.51 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  40.41 
 
 
555 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
536 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  33.16 
 
 
379 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  35.91 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  33.62 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.69 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.81 
 
 
430 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  41.57 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  40.64 
 
 
393 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.02 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.94 
 
 
433 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  40.42 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.93 
 
 
419 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
441 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  48.06 
 
 
357 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  35.96 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  33.52 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.93 
 
 
443 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  36.44 
 
 
414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
441 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.76 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  40.37 
 
 
457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  36.68 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2446  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.37 
 
 
601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57665  normal  0.0973248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.64 
 
 
478 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
430 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  38.21 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.73 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
423 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.7 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  40.74 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
439 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
612 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  39.04 
 
 
428 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  42.08 
 
 
408 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  41.41 
 
 
419 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  35.53 
 
 
399 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
406 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
423 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  34.57 
 
 
518 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.72 
 
 
386 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  34.71 
 
 
458 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
398 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
467 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  36.01 
 
 
417 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  32.36 
 
 
395 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  36.79 
 
 
461 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  41.11 
 
 
375 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  33.24 
 
 
384 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40.77 
 
 
399 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.22 
 
 
386 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  42.64 
 
 
434 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  39.56 
 
 
381 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  38.61 
 
 
409 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
496 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  42.01 
 
 
393 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.29 
 
 
423 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
394 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>