More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2107 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  100 
 
 
401 aa  800    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.75 
 
 
415 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  32.47 
 
 
420 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  42.39 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
424 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
416 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  30.77 
 
 
438 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
405 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.16 
 
 
419 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  30.03 
 
 
445 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
386 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
413 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  37.55 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
536 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.26 
 
 
408 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  38.75 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.55 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  33.12 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.96 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.24 
 
 
384 aa  116  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  31.55 
 
 
393 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.29 
 
 
400 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.1 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  33.52 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  30.57 
 
 
371 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
387 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.33 
 
 
446 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.67 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  30.33 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
612 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.87 
 
 
367 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  37.13 
 
 
395 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  29.88 
 
 
402 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
406 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  38.08 
 
 
380 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.75 
 
 
392 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
438 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.62 
 
 
433 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.92 
 
 
399 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.51 
 
 
422 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.5 
 
 
367 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.32 
 
 
381 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
394 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  30.21 
 
 
424 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.41 
 
 
384 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  33.99 
 
 
447 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.77 
 
 
430 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
441 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
373 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  28.71 
 
 
389 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  33.33 
 
 
388 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  31.05 
 
 
375 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  37.96 
 
 
386 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  35.33 
 
 
434 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  32.41 
 
 
405 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  33.85 
 
 
407 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  33.33 
 
 
555 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  30.14 
 
 
403 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.99 
 
 
378 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
469 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  33.08 
 
 
416 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.5 
 
 
567 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
394 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  30.47 
 
 
410 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
421 aa  100  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  34.91 
 
 
375 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.3 
 
 
399 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.25 
 
 
400 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
391 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
424 aa  99.4  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  34.29 
 
 
393 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.82 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.61 
 
 
407 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.74 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  32.21 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.37 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
601 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.47 
 
 
430 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  29.31 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  33.18 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.28 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.01 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.63 
 
 
401 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.06 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  33.46 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
441 aa  96.3  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  34.31 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  36.36 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.96 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.92 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  29.18 
 
 
445 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  29.1 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  35.36 
 
 
449 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>