More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5720 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  100 
 
 
439 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  47.63 
 
 
417 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
420 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  49.7 
 
 
410 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  46.35 
 
 
408 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  40.27 
 
 
422 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  43.23 
 
 
405 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  38.18 
 
 
402 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  46.09 
 
 
384 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
398 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  40.61 
 
 
423 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  40.48 
 
 
395 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  40.87 
 
 
394 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
420 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  38.46 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.94 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  41.58 
 
 
372 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  36.78 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.99 
 
 
399 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
394 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
445 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
441 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
439 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  40.13 
 
 
372 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.05 
 
 
407 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  44.18 
 
 
421 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.52 
 
 
386 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  44.2 
 
 
398 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  34.61 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  37.02 
 
 
433 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  38.5 
 
 
385 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
503 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  35.54 
 
 
428 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  34.42 
 
 
442 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  40.89 
 
 
478 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
484 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
424 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.1 
 
 
399 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  36.77 
 
 
393 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.67 
 
 
424 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  42.22 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.92 
 
 
392 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.2 
 
 
392 aa  146  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.16 
 
 
414 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  36.39 
 
 
384 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.59 
 
 
443 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  37.39 
 
 
432 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.01 
 
 
378 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
470 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
406 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  40.15 
 
 
428 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
394 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  44.14 
 
 
419 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
405 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  34.99 
 
 
458 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.47 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.57 
 
 
383 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  40.74 
 
 
449 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  38.2 
 
 
402 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
469 aa  139  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  35.42 
 
 
424 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  37.85 
 
 
434 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.12 
 
 
430 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  35.77 
 
 
372 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.42 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  34.63 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  41.42 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  32.8 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  35.14 
 
 
367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  37.15 
 
 
380 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
444 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  33.43 
 
 
371 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
500 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.08 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.95 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  32.63 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
421 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.91 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.24 
 
 
271 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
386 aa  128  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0325  putative two-component system sensor kinase  34.55 
 
 
392 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38.59 
 
 
369 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  31.83 
 
 
402 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  33.24 
 
 
380 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  34.28 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.83 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  37.86 
 
 
374 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
508 aa  126  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0044423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.43 
 
 
406 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  32.23 
 
 
408 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2600  histidine kinase  37.5 
 
 
489 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
524 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00577691  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
413 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
467 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>