More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2009 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  100 
 
 		 395 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  57.78 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  37.56 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 		 416 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.03 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.58 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  36.31 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 536 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  36.23 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  35.33 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  41.56 
 
 		 371 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.43 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  43.28 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.05 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.13 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  33.99 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  45.23 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.02 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  44.06 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.53 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  38.91 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  37.21 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  36.86 
 
 		 445 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.31 
 
 		 421 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.69 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.93 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 612 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  36.1 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.37 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  44.75 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  42.66 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  40.56 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  42.12 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  38.21 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.09 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.85 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.57 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.82 
 
 		 430 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  37.28 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  39.84 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  41.4 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  34.75 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.21 
 
 		 567 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.21 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  42.92 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.09 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 441 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  39.53 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  44.95 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  39.57 
 
 		 407 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.69 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  36.5 
 
 		 518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.05 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.63 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.94 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  37.86 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.9 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.48 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  43.16 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  36.52 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  40.99 
 
 		 555 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.44 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  36.14 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.4 
 
 		 430 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  45.92 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  40.59 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  36.97 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  39.57 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  39.53 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  31.75 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.88 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  38.3 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  33.22 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  44.22 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  30.55 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  36.68 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>