More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7657 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  100 
 
 
434 aa  848    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.7 
 
 
469 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.58 
 
 
367 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  40.43 
 
 
393 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.33 
 
 
446 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 
360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  47.15 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.86 
 
 
384 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 
424 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
449 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  45.15 
 
 
425 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
386 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
418 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.94 
 
 
389 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 
401 aa  179  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  43.55 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.61 
 
 
419 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  44.75 
 
 
461 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.79 
 
 
379 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  38.6 
 
 
442 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  43.98 
 
 
420 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.84 
 
 
415 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  46.5 
 
 
393 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.73 
 
 
398 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
394 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.64 
 
 
371 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  48.02 
 
 
375 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
420 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
373 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
435 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.8 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
413 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  39.93 
 
 
442 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  43.68 
 
 
421 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  42.8 
 
 
423 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  44.4 
 
 
386 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  43.37 
 
 
395 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.05 
 
 
397 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
536 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  44.44 
 
 
389 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.47 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  35.93 
 
 
445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
430 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  41.55 
 
 
438 aa  136  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  38.78 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  43.08 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  41.58 
 
 
383 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  42.36 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.53 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.33 
 
 
433 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
394 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
869 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.64 
 
 
430 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.76 
 
 
393 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  35.38 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36.59 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.25 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  38.14 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.06 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
423 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
441 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
403 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  38.68 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  36.54 
 
 
374 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
394 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
405 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  42.17 
 
 
445 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  34.82 
 
 
375 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.92 
 
 
395 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
404 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.61 
 
 
443 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.18 
 
 
400 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  37.36 
 
 
428 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  37.9 
 
 
402 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.85 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  37.69 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  34.81 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  40.5 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  36.19 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  38.53 
 
 
453 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  45.93 
 
 
393 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  34.22 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  37.62 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  39.83 
 
 
555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  34.02 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  38.25 
 
 
462 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  32.65 
 
 
408 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.42 
 
 
386 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
438 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>