More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5877 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  100 
 
 
419 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  50.24 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  39.93 
 
 
400 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  44.72 
 
 
399 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  46.01 
 
 
395 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  45.79 
 
 
408 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  39.54 
 
 
438 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  44.75 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  42.53 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
403 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  42.63 
 
 
410 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  41.28 
 
 
433 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  42.34 
 
 
422 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
441 aa  143  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.59 
 
 
392 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  36 
 
 
478 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  39.21 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.08 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
420 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  38.64 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  41.94 
 
 
405 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
405 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
496 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.21 
 
 
430 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  42.91 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  44.3 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6236  histidine kinase  37.97 
 
 
387 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.39934  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.69 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  40.07 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.8 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.45 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  40 
 
 
439 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.57 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  43.12 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  43.53 
 
 
367 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  43.78 
 
 
402 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
423 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  42.4 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  39.24 
 
 
392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  43.3 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  42.41 
 
 
381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.45 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  42.92 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  37.29 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.33 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40.15 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  43.32 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.91 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
387 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  45.16 
 
 
372 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  36.77 
 
 
384 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  43.2 
 
 
442 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.74 
 
 
406 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.73 
 
 
369 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
441 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
445 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  42.92 
 
 
408 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
398 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  43.57 
 
 
449 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
379 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.31 
 
 
370 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.22 
 
 
400 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.71 
 
 
370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  35.35 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.69 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  40.82 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.91 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  37.23 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  39.65 
 
 
462 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.04 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  38.64 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  36.74 
 
 
416 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  43.19 
 
 
384 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  39.64 
 
 
380 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  40.91 
 
 
372 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  40.09 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.3 
 
 
357 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.3 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  40.62 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  35.06 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.67 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.34 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  36.01 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  36.14 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
424 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
392 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>