More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1603 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 		 470 aa  944    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  28.39 
 
 		 458 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  34.31 
 
 		 393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  33.33 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 394 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.98 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  33.46 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.73 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.58 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  31.2 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0270  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.17 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 416 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.2 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  32.58 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.48 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  28.32 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.57 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  29.96 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.68 
 
 		 399 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  31.7 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.7 
 
 		 430 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.37 
 
 		 379 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  30.48 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 383 aa  96.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  30.36 
 
 		 384 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.01 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  29.5 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 360 aa  94  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  31.56 
 
 		 403 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  27 
 
 		 401 aa  93.2  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  29.59 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  30.32 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 612 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.73 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.85 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  30.6 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  33.17 
 
 		 313 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  30.65 
 
 		 375 aa  90.9  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0177  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.94 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.17 
 
 		 422 aa  90.9  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 438 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  29.46 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 393 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  28.38 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.39 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  29.41 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  32.23 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  31.78 
 
 		 402 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 391 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15920  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 367 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.89616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 442 aa  87  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5263  histidine kinase  29.46 
 
 		 518 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  34.2 
 
 		 421 aa  86.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  31.39 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  34.12 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  30.56 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  31.48 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.28 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  30.7 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  30.99 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  29.64 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  28.63 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.74 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  27.6 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  33.03 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.02 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  34.15 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  29.39 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  30.62 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  30.87 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  33.66 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.59 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  27.43 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  29.72 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>