More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8792 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
380 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
403 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  42.67 
 
 
381 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  45.91 
 
 
372 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.15 
 
 
394 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.26 
 
 
370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  45.79 
 
 
395 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  41.95 
 
 
380 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  44.48 
 
 
380 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  39.22 
 
 
380 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  40.48 
 
 
442 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  40.36 
 
 
393 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  41.39 
 
 
408 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  40.45 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  38.57 
 
 
393 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
496 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
445 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  47.03 
 
 
462 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.21 
 
 
399 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  39.53 
 
 
405 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.07 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  45.88 
 
 
367 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  38.91 
 
 
399 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 
393 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.54 
 
 
430 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  39.6 
 
 
387 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  49.24 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  35.73 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
441 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
388 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  46.97 
 
 
375 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  36.12 
 
 
478 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44 
 
 
401 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.91 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.44 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.97 
 
 
443 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.59 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  38.52 
 
 
430 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.45 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  39.06 
 
 
443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
421 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.53 
 
 
400 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  33.63 
 
 
378 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
441 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.55 
 
 
392 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.72 
 
 
406 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.25 
 
 
392 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.1 
 
 
400 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  34.62 
 
 
391 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
406 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
360 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.61 
 
 
438 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  35.1 
 
 
428 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  34.11 
 
 
376 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.54 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  39.93 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  41.98 
 
 
402 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  37.89 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
394 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.11 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  40.2 
 
 
384 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  38.42 
 
 
426 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  42.41 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  33.24 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  41.96 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  38.34 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40.23 
 
 
399 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  38.31 
 
 
447 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  40.41 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  37.44 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.08 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  34.13 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  40.24 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  33.71 
 
 
453 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 
398 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
404 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
500 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.17 
 
 
357 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  38.02 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  38.6 
 
 
407 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.86 
 
 
379 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  33.82 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  42.72 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.04 
 
 
371 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  40.65 
 
 
382 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
382 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  41.13 
 
 
393 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  43 
 
 
457 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  36.44 
 
 
413 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  35.21 
 
 
445 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>