More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 406 aa  791    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 396 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.79 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.08 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 496 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  33.51 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.06 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  35.24 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  31.51 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.47 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  41.76 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.26 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 467 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  35.07 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  33.69 
 
 		 393 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.46 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  30.98 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.74 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.53 
 
 		 446 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.61 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.32 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  32.71 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.48 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 441 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.57 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  30.18 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  30.71 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.79 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  33.83 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  28.18 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.55 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  31.62 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 441 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.84 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  31.99 
 
 		 399 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.37 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  32.46 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  34.33 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  31.53 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.53 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  31.46 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  30.96 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  32.86 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  30.97 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  34.85 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 612 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  31.45 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.69 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.11 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  30 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  31.37 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  31.2 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  31.3 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  33.33 
 
 		 555 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  31.61 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.58 
 
 		 424 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 423 aa  99.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  27.58 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  30.17 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.32 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.72 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  28.79 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  32.76 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.7 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  31.6 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.56 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 536 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  36.02 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 500 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  30.22 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  33.47 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  29.55 
 
 		 478 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.8 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  29.43 
 
 		 376 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  32.44 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  31.79 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  33.76 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>