More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2659 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
453 aa  880    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  38.71 
 
 
408 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
396 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.35 
 
 
393 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
439 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  38.2 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.3 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.41 
 
 
381 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  37.6 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.4 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
441 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  32.4 
 
 
393 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
403 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.18 
 
 
402 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
424 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
394 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.83 
 
 
384 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.45 
 
 
430 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
445 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
496 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  37.39 
 
 
408 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  33.98 
 
 
414 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.82 
 
 
370 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  36.89 
 
 
372 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  35.47 
 
 
391 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.2 
 
 
384 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  32.2 
 
 
478 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  32.51 
 
 
393 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  33.05 
 
 
439 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  33.15 
 
 
395 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
401 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.67 
 
 
414 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
394 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  39.56 
 
 
387 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.68 
 
 
442 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
383 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.57 
 
 
380 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  31.45 
 
 
370 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  32.19 
 
 
420 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.25 
 
 
380 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
391 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
441 aa  100  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
394 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.1 
 
 
378 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  33.74 
 
 
367 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  37.8 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.68 
 
 
408 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.21 
 
 
421 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.95 
 
 
430 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  39.77 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  35.78 
 
 
357 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  31.01 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.11 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  37.02 
 
 
380 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
469 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  33.82 
 
 
291 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.1 
 
 
405 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
467 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  31.15 
 
 
416 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  37.35 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  34.58 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  33.64 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.25 
 
 
357 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.73 
 
 
385 aa  94  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.07 
 
 
423 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  33.98 
 
 
380 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
386 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0235  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.16 
 
 
435 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  34.41 
 
 
395 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.56 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  31.15 
 
 
399 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.34 
 
 
392 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
444 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  34.43 
 
 
399 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
441 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.74 
 
 
379 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0337  histidine kinase  35.22 
 
 
408 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  36.24 
 
 
555 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.05 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
372 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  34.01 
 
 
445 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.74 
 
 
401 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.31 
 
 
430 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  29.52 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  37.6 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  33.46 
 
 
397 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  33.33 
 
 
410 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  31.05 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.02 
 
 
398 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>