More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1620 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  100 
 
 
380 aa  734    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  63.3 
 
 
384 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  62.79 
 
 
390 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  61.56 
 
 
384 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.2 
 
 
387 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  55.91 
 
 
384 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.63 
 
 
386 aa  342  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7416  histidine kinase  48.52 
 
 
378 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375707  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 
382 aa  212  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.73 
 
 
400 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.69 
 
 
405 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  37.71 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.6 
 
 
430 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.76 
 
 
433 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  47.09 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
441 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.05 
 
 
399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  36.15 
 
 
408 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  35.04 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  38.54 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.54 
 
 
379 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.36 
 
 
430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.01 
 
 
407 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.11 
 
 
408 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.38 
 
 
406 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
424 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
406 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.49 
 
 
388 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.37 
 
 
399 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.87 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.03 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  32.33 
 
 
438 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.09 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  44.22 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.27 
 
 
378 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  40.82 
 
 
367 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  34.25 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
404 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.13 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
612 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.9 
 
 
397 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  38.96 
 
 
384 aa  116  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  36.2 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.12 
 
 
417 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  40.57 
 
 
457 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  38.24 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.54 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.36 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  35.82 
 
 
478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.4 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  34.86 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  31.43 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
469 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.49 
 
 
446 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.34 
 
 
415 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  32.94 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.27 
 
 
422 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  35.88 
 
 
453 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
423 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.34 
 
 
567 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  34.4 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
386 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.68 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.13 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  33.52 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  36.36 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
418 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  36.96 
 
 
291 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  39.29 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  41.7 
 
 
420 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  41.62 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
445 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.05 
 
 
370 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.09 
 
 
439 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
500 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  34.88 
 
 
423 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
394 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
400 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
386 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.59 
 
 
378 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
401 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.43 
 
 
271 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  38.94 
 
 
458 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  31.81 
 
 
393 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  34.44 
 
 
395 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
420 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
536 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  33.14 
 
 
387 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  31.61 
 
 
392 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  39.81 
 
 
381 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
388 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  39.29 
 
 
393 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>