More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4861 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  92.05 
 
 
384 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  100 
 
 
390 aa  760    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  67.1 
 
 
384 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  61.82 
 
 
384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.95 
 
 
387 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  62.79 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.66 
 
 
386 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7416  histidine kinase  53.62 
 
 
378 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375707  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 
382 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.25 
 
 
400 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.89 
 
 
405 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.05 
 
 
433 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.91 
 
 
438 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
420 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.86 
 
 
430 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
500 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  37.4 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  35.62 
 
 
402 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  41.57 
 
 
367 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.41 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.29 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  33.99 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.29 
 
 
408 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  33.82 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.82 
 
 
478 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  32.4 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.14 
 
 
423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.29 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.43 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.55 
 
 
386 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  38.82 
 
 
291 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.14 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.87 
 
 
443 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
398 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  40.76 
 
 
369 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  37.94 
 
 
430 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
439 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.68 
 
 
392 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
394 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.17 
 
 
397 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.45 
 
 
406 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
424 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  30.75 
 
 
378 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.74 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  36.31 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  40.28 
 
 
457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.54 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  37.41 
 
 
443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.5 
 
 
424 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  36.73 
 
 
470 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  32.11 
 
 
376 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
441 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  33.23 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.58 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  30.91 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.46 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  31.6 
 
 
393 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
469 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  33.14 
 
 
395 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  39.37 
 
 
359 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
470 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
423 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  36.21 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  39.18 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.22 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  34.18 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  32.94 
 
 
372 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
405 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.8 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.53 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  33.2 
 
 
388 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  34.29 
 
 
407 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.06 
 
 
439 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  32.14 
 
 
408 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
416 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.78 
 
 
442 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.23 
 
 
380 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
392 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  39.69 
 
 
378 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.34 
 
 
370 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  35.48 
 
 
419 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.94 
 
 
407 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.78 
 
 
383 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.33 
 
 
567 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  35.71 
 
 
462 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  35.11 
 
 
399 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
444 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  32.38 
 
 
426 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  36.05 
 
 
394 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  31.76 
 
 
432 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  32.41 
 
 
428 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.39 
 
 
430 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  37.05 
 
 
380 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  34.69 
 
 
388 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>