More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3520 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3520  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
391 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
500 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.96 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.39 
 
 
386 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.79 
 
 
424 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.73 
 
 
430 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  38.01 
 
 
384 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.25 
 
 
407 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
424 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  30.08 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.1 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  34.84 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
441 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35 
 
 
443 aa  93.6  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.29 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  33.89 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
416 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.73 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.34 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.38 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  36.04 
 
 
430 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.06 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  34.21 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.38 
 
 
392 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  36.03 
 
 
390 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  28.91 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
470 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  35.41 
 
 
372 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  29.03 
 
 
405 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  34.65 
 
 
394 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  31.84 
 
 
399 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  33.47 
 
 
458 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
387 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  31.25 
 
 
397 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  34.55 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  36.69 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  28.27 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  34.69 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  30.19 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  31.53 
 
 
429 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.68 
 
 
567 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  36 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.44 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  34.48 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.75 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0325  putative two-component system sensor kinase  34.88 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.76 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
869 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.19 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  30.89 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  29.1 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  35.35 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.63 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  30.77 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  38.49 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  32.38 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.61 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.58 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.93 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  23.33 
 
 
595 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  32.87 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.38 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
503 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  32.7 
 
 
555 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  29.72 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  31.25 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7416  histidine kinase  34.65 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375707  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  34.08 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
601 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  35.32 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  32.4 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  30.83 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.02 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  24.1 
 
 
592 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  32.86 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.71 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  31.5 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  35.45 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  32.03 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  32.2 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  35.68 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  32.76 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>