More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1008 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
374 aa  714    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  37.79 
 
 
381 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  42.86 
 
 
389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  38.53 
 
 
372 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
392 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  35 
 
 
388 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
379 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  36.72 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
601 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.52 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
418 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
424 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
391 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  34.33 
 
 
375 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  38.31 
 
 
385 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  38.53 
 
 
442 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
394 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  38.36 
 
 
379 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
439 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
496 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
406 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.8 
 
 
392 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.39 
 
 
370 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  33.33 
 
 
414 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.71 
 
 
567 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  37.02 
 
 
386 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  39.47 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
403 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  37.61 
 
 
380 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.91 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
536 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  35.12 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  35.78 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35 
 
 
408 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6305  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.15 
 
 
365 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177267  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.27 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0184  regulatory protein LuxR  31.64 
 
 
489 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  39.61 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0295  histidine kinase  39.82 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.856795  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
401 aa  96.3  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  31.92 
 
 
422 aa  96.3  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.11 
 
 
378 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  37.07 
 
 
359 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  38.97 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  31.35 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.11 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  36.49 
 
 
457 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.65 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  35.56 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.49 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.13 
 
 
399 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  34.36 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.02 
 
 
407 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.59 
 
 
433 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
416 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  28.81 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.21 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
612 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
469 aa  92.8  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.48 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0337  histidine kinase  35.53 
 
 
408 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
470 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
467 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  35.78 
 
 
402 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.07 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  37.1 
 
 
397 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  33.06 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
445 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  35.07 
 
 
445 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
426 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  32 
 
 
478 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  39.57 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.23 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  33.07 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  36.27 
 
 
430 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  33.82 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  36.32 
 
 
426 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  32.02 
 
 
372 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.38 
 
 
407 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  27.54 
 
 
400 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.07 
 
 
423 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  36.5 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  33.84 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
442 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  29.32 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  34.47 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.4 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>