More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2519 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
391 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  42.43 
 
 
381 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  45.08 
 
 
351 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  40.44 
 
 
389 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  42.21 
 
 
359 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  39.4 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
601 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.42 
 
 
407 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
420 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  35.41 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  40.22 
 
 
388 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  34.67 
 
 
417 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
379 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  36.68 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  43.56 
 
 
382 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.12 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.39 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  39.37 
 
 
380 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  36.25 
 
 
458 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  40.25 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.54 
 
 
443 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  42.62 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
484 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
392 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  39.73 
 
 
379 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  38.84 
 
 
422 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.4 
 
 
381 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  37.04 
 
 
414 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.97 
 
 
478 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  38.41 
 
 
397 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.72 
 
 
442 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
394 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
441 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
387 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  39.47 
 
 
395 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.39 
 
 
406 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.94 
 
 
407 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  34.43 
 
 
395 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40 
 
 
402 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  32.86 
 
 
421 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  35.65 
 
 
438 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  37.5 
 
 
408 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  38.94 
 
 
394 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3005  histidine kinase  37.02 
 
 
387 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  36.55 
 
 
379 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.61 
 
 
430 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.94 
 
 
367 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  37.82 
 
 
405 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.37 
 
 
392 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
869 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.35 
 
 
401 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  36.2 
 
 
433 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.55 
 
 
567 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  33.61 
 
 
397 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
441 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  35.8 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  38.49 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
398 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
439 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  37.74 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  34.36 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.66 
 
 
424 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.28 
 
 
399 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4135  putative signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
444 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  38.07 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  39.29 
 
 
449 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.18 
 
 
392 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.77 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.06 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  35.53 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  34.66 
 
 
462 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  32.06 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  33.57 
 
 
447 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.87 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  38.03 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.29 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.28 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  39.27 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  36.07 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  36.32 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
392 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  40.68 
 
 
428 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  34.33 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  35.39 
 
 
372 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  32.56 
 
 
408 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  37.86 
 
 
393 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
500 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.79 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
503 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  35.9 
 
 
380 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.04 
 
 
442 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
440 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.5 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>