More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0966 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 332 aa  667    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  35.28 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  46.4 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  45.95 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  45.95 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  45.95 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  46.4 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  45.95 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  45.95 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  45.95 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  45.95 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  45.5 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  41.95 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  41.1 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  33.19 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 725 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  34.48 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 575 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.96 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  28.41 
 
 		 575 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  28 
 
 		 740 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.75 
 
 		 598 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.6 
 
 		 683 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 598 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  31.1 
 
 		 1739 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  34.02 
 
 		 282 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  32.17 
 
 		 2361 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 1168 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 658 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 564 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 682 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 591 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  32.76 
 
 		 373 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.96 
 
 		 640 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 594 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  30.54 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 692 aa  105  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 573 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 748 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  33.49 
 
 		 662 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 742 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 644 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 450 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.65 
 
 		 489 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 775 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 595 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 596 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.24 
 
 		 1033 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.16 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 700 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 591 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 475 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  32.52 
 
 		 596 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  30 
 
 		 653 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.19 
 
 		 799 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32 
 
 		 1809 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  32.89 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 541 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 682 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  29.96 
 
 		 619 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 411 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 447 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  33.33 
 
 		 223 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  32.3 
 
 		 797 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 363 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  29.96 
 
 		 680 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  29.96 
 
 		 680 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 384 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 582 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 484 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 610 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 373 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 448 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  30.43 
 
 		 687 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 665 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>