More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0117 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.62 
 
 
1845 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  32.37 
 
 
2109 aa  824    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  35.36 
 
 
1809 aa  961    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  100 
 
 
2361 aa  4848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.36 
 
 
1780 aa  1281    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  34.45 
 
 
1833 aa  994    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  44.12 
 
 
1901 aa  1298    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.34 
 
 
1805 aa  1131    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  43.08 
 
 
1934 aa  1274    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.44 
 
 
1804 aa  1267    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.28 
 
 
2017 aa  1224    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.4 
 
 
1794 aa  1167    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  45.59 
 
 
1850 aa  1347    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.33 
 
 
1797 aa  1229    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.26 
 
 
1795 aa  1211    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.49 
 
 
1808 aa  1211    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  34.81 
 
 
1885 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  32.36 
 
 
1697 aa  751    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  45.27 
 
 
2051 aa  1303    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  35.34 
 
 
1837 aa  895    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  36.66 
 
 
2279 aa  896    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  45.09 
 
 
1908 aa  1298    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  31.32 
 
 
1836 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 
1644 aa  781    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  36.98 
 
 
2272 aa  898    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  39.24 
 
 
2077 aa  1172    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.88 
 
 
1668 aa  785    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
670 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
1942 aa  1298    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  41.15 
 
 
1811 aa  1120    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  43.72 
 
 
1805 aa  1229    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
1932 aa  1224    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  44.95 
 
 
1914 aa  1257    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.52 
 
 
1663 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.7 
 
 
1822 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  33.82 
 
 
1871 aa  801    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  38.31 
 
 
1922 aa  998    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.22 
 
 
1780 aa  896    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.07 
 
 
1774 aa  953    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  31.54 
 
 
1712 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  35.97 
 
 
2303 aa  847    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.96 
 
 
1797 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.68 
 
 
1739 aa  696    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
1123 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30.23 
 
 
1685 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.98 
 
 
1685 aa  566  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.92 
 
 
1832 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.99 
 
 
1788 aa  516  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.34 
 
 
1885 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.15 
 
 
1748 aa  486  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.41 
 
 
1744 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
1643 aa  473  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
1637 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  28.01 
 
 
1710 aa  464  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
1629 aa  460  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.51 
 
 
1756 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.39 
 
 
1685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
1636 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.35 
 
 
1682 aa  427  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  26.42 
 
 
1682 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  29.25 
 
 
1112 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  28.08 
 
 
1064 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 
1726 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  27.78 
 
 
1060 aa  393  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
1473 aa  332  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
1473 aa  332  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  26.2 
 
 
1473 aa  331  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
1649 aa  329  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  25.69 
 
 
1123 aa  328  6e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  25.78 
 
 
1255 aa  300  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
3706 aa  253  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  25.8 
 
 
900 aa  224  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  27.39 
 
 
1774 aa  205  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1407 aa  193  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1965 aa  192  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  21.55 
 
 
2312 aa  185  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  22.85 
 
 
1377 aa  184  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
1044 aa  182  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
768 aa  179  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  23.68 
 
 
1015 aa  175  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
1051 aa  169  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
1131 aa  167  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.37 
 
 
1058 aa  167  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2558  signal transduction protein  52.82 
 
 
1061 aa  164  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139112  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  21.39 
 
 
1086 aa  163  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
652 aa  163  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
1229 aa  163  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.61 
 
 
1927 aa  162  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
1820 aa  160  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  26.19 
 
 
1226 aa  158  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  26.56 
 
 
1101 aa  155  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 
858 aa  151  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
1246 aa  149  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
508 aa  149  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
1611 aa  149  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  25.32 
 
 
749 aa  148  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  28.06 
 
 
637 aa  148  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1546  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.31 
 
 
1098 aa  148  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 
1714 aa  148  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 
1578 aa  147  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>