More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1593 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1377 aa  2721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2768  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
1446 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
1192 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0224  serine/threonine protein kinase  36.24 
 
 
1295 aa  330  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 
1297 aa  325  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
1188 aa  306  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2767  serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 
1514 aa  299  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.83 
 
 
1131 aa  297  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.95 
 
 
1833 aa  237  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  24.58 
 
 
1809 aa  232  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  25.15 
 
 
1697 aa  232  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.97 
 
 
1797 aa  227  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.36 
 
 
1780 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.28 
 
 
1794 aa  212  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 
1942 aa  211  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  25.08 
 
 
1712 aa  209  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  21.71 
 
 
2077 aa  208  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.5 
 
 
1871 aa  197  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  20.31 
 
 
1914 aa  195  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.92 
 
 
1774 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.71 
 
 
1685 aa  188  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  24.8 
 
 
1922 aa  186  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.97 
 
 
1685 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.6 
 
 
1845 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  22.38 
 
 
2279 aa  174  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.42 
 
 
1663 aa  165  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.45 
 
 
1668 aa  163  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  26.34 
 
 
1744 aa  159  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.23 
 
 
1885 aa  156  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.22 
 
 
1748 aa  152  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  22.52 
 
 
1932 aa  146  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.4 
 
 
1901 aa  145  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  22.52 
 
 
1805 aa  145  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.14 
 
 
2051 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  21.62 
 
 
1811 aa  133  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.08 
 
 
1795 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
1644 aa  127  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.15 
 
 
2272 aa  127  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  29.66 
 
 
1837 aa  125  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3652  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
363 aa  125  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  26.81 
 
 
1850 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3726  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 
351 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
1235 aa  124  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.77 
 
 
2303 aa  119  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  26.26 
 
 
1836 aa  118  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.31 
 
 
1682 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.81 
 
 
1822 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3707  protein kinase  29.88 
 
 
348 aa  118  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  24.49 
 
 
1788 aa  115  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 
1637 aa  114  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  24.54 
 
 
1934 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.85 
 
 
1710 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.18 
 
 
1808 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.1 
 
 
1682 aa  113  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.32 
 
 
1797 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3586  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
363 aa  112  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
1636 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  23.61 
 
 
670 aa  111  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1908 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  23.7 
 
 
1774 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.56 
 
 
1805 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.07 
 
 
1804 aa  106  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
1643 aa  105  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
678 aa  103  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
344 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
842 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.41 
 
 
916 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
636 aa  102  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.87 
 
 
598 aa  102  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 
647 aa  100  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
641 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
1726 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.02 
 
 
620 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  21.71 
 
 
2361 aa  99.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 
614 aa  99  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  35.86 
 
 
325 aa  99  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 
651 aa  98.6  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.91 
 
 
1832 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.69 
 
 
667 aa  98.6  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.24 
 
 
658 aa  97.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.05 
 
 
707 aa  97.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  23.37 
 
 
1685 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38 
 
 
1036 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 
1629 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
938 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  36.75 
 
 
642 aa  96.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.2 
 
 
591 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.54 
 
 
658 aa  95.9  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 
444 aa  95.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.5 
 
 
593 aa  95.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.24 
 
 
2017 aa  95.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.39 
 
 
869 aa  95.5  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.07 
 
 
614 aa  95.1  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
612 aa  95.1  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
1152 aa  95.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  27.43 
 
 
2109 aa  95.1  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.72 
 
 
863 aa  95.1  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
710 aa  95.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  35 
 
 
666 aa  94.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
646 aa  94.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>