More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2556 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  29.7 
 
 		 1885 aa  708    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  33.57 
 
 		 2303 aa  727    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.11 
 
 		 1845 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  39.81 
 
 		 1805 aa  1044    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.7 
 
 		 1809 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.64 
 
 		 2109 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.97 
 
 		 1774 aa  996    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  35.13 
 
 		 2279 aa  791    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  32.3 
 
 		 1837 aa  793    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.76 
 
 		 1663 aa  668    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  29.99 
 
 		 1644 aa  652    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  41.15 
 
 		 2361 aa  1092    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.83 
 
 		 1780 aa  1422    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  46.46 
 
 		 1901 aa  1636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.48 
 
 		 1805 aa  1444    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  45.81 
 
 		 1934 aa  1291    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  51.25 
 
 		 1804 aa  1842    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  51.26 
 
 		 2017 aa  1518    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  44.58 
 
 		 1794 aa  1521    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  48.33 
 
 		 1850 aa  1647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.53 
 
 		 1797 aa  1537    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.94 
 
 		 1795 aa  1533    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.18 
 
 		 1808 aa  1362    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.85 
 
 		 1712 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.41 
 
 		 1822 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.86 
 
 		 1668 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 1811 aa  3732    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.18 
 
 		 1780 aa  911    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  38.34 
 
 		 1908 aa  1055    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 1123 aa  778    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  34.75 
 
 		 2272 aa  770    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  29.08 
 
 		 1871 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.7 
 
 		 1697 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  39.36 
 
 		 2077 aa  1041    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  55.92 
 
 		 670 aa  777    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  37.91 
 
 		 1914 aa  985    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  38.38 
 
 		 2051 aa  1194    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  32.47 
 
 		 1833 aa  832    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  34.36 
 
 		 1922 aa  861    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 1942 aa  1308    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  40.01 
 
 		 1932 aa  1063    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  28.26 
 
 		 1836 aa  635  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.72 
 
 		 1797 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27.24 
 
 		 1739 aa  571  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.1 
 
 		 1832 aa  523  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.21 
 
 		 1788 aa  445  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  24.4 
 
 		 1685 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  24.3 
 
 		 1744 aa  440  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.02 
 
 		 1682 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  24.88 
 
 		 1710 aa  424  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  23.85 
 
 		 1682 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 1637 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 		 1636 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.82 
 
 		 1885 aa  358  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  28.5 
 
 		 1756 aa  340  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 641 aa  335  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  25.27 
 
 		 1112 aa  333  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 594 aa  326  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  53.26 
 
 		 971 aa  322  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  25.48 
 
 		 1060 aa  322  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 		 715 aa  322  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 		 699 aa  313  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.02 
 
 		 1685 aa  312  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 		 537 aa  311  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  27.04 
 
 		 1685 aa  311  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  53.54 
 
 		 468 aa  310  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 675 aa  310  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.23 
 
 		 439 aa  309  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 		 688 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 468 aa  305  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  50.33 
 
 		 468 aa  304  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 1072 aa  301  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 1629 aa  300  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 680 aa  300  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.52 
 
 		 1064 aa  299  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 		 1643 aa  299  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 1036 aa  295  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 928 aa  294  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 		 591 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.71 
 
 		 437 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  49.66 
 
 		 458 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 470 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.63 
 
 		 585 aa  291  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  51.12 
 
 		 551 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.65 
 
 		 1123 aa  285  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 440 aa  285  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 1649 aa  281  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.96 
 
 		 1748 aa  280  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 1726 aa  271  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 920 aa  271  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 443 aa  262  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.01 
 
 		 407 aa  261  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  23.61 
 
 		 1473 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 437 aa  259  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  23.61 
 
 		 1473 aa  258  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  23.61 
 
 		 1473 aa  258  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 390 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  42.38 
 
 		 708 aa  242  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>