More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2857 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  32.66 
 
 
1644 aa  835    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.77 
 
 
1845 aa  981    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.62 
 
 
1780 aa  910    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.88 
 
 
1942 aa  1166    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.82 
 
 
1774 aa  920    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.24 
 
 
1663 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  43.72 
 
 
2361 aa  1207    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  47.34 
 
 
1780 aa  1325    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.56 
 
 
1901 aa  1188    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.01 
 
 
1805 aa  1099    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  43.31 
 
 
1934 aa  1231    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.94 
 
 
1804 aa  1169    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.95 
 
 
2017 aa  1073    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.81 
 
 
1794 aa  1099    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  42.9 
 
 
1850 aa  1215    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.66 
 
 
1797 aa  1129    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.93 
 
 
1795 aa  1173    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.8 
 
 
1808 aa  1143    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  31.63 
 
 
1871 aa  754    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  29.41 
 
 
1697 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  34.9 
 
 
1837 aa  948    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.35 
 
 
1822 aa  818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.93 
 
 
1668 aa  797    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  34.22 
 
 
1885 aa  881    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  30.51 
 
 
1836 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  30.22 
 
 
1712 aa  691    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  36.93 
 
 
1922 aa  1070    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.3 
 
 
2109 aa  770    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 
1914 aa  1239    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  41.19 
 
 
2077 aa  1095    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  35.52 
 
 
1809 aa  962    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 
1908 aa  1235    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  33.62 
 
 
1833 aa  943    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  36.07 
 
 
2272 aa  900    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  43.55 
 
 
2051 aa  1259    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.9 
 
 
1797 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  50.15 
 
 
670 aa  689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  39.81 
 
 
1811 aa  1053    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1805 aa  3682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  94.76 
 
 
1932 aa  2913    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.3 
 
 
1739 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  35.17 
 
 
2303 aa  870    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  35.38 
 
 
2279 aa  897    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.68 
 
 
1788 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.52 
 
 
1885 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  25.82 
 
 
1685 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  25.95 
 
 
1685 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
1123 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  25.62 
 
 
1744 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.14 
 
 
1748 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.39 
 
 
1756 aa  476  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.47 
 
 
1832 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.76 
 
 
1685 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  24.85 
 
 
1473 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 
1637 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  24.59 
 
 
1473 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  24.59 
 
 
1473 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
1643 aa  453  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 
1636 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.33 
 
 
1682 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.45 
 
 
1710 aa  436  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  25.21 
 
 
1682 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 
1629 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  23.81 
 
 
1726 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  27.24 
 
 
1064 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.21 
 
 
1112 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  26.86 
 
 
1060 aa  356  2.9999999999999997e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.3 
 
 
1123 aa  326  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
1649 aa  319  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  55.56 
 
 
1119 aa  308  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  47.23 
 
 
1133 aa  261  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  46.49 
 
 
1130 aa  261  7e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  23.92 
 
 
1255 aa  245  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  42.11 
 
 
482 aa  218  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  28.35 
 
 
1774 aa  198  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.59 
 
 
900 aa  198  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 
364 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  36.44 
 
 
358 aa  174  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  36.46 
 
 
734 aa  169  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0154  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.71 
 
 
692 aa  166  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.152136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.83 
 
 
696 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  37.24 
 
 
903 aa  163  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  20.84 
 
 
2312 aa  159  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1171  intracellular signalling protein  33.09 
 
 
690 aa  159  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
746 aa  157  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.44 
 
 
859 aa  156  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 
740 aa  156  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 
1235 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  32.71 
 
 
701 aa  153  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
860 aa  152  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  31.87 
 
 
701 aa  152  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0863  adenylate/guanylate cyclase family protein  31.94 
 
 
272 aa  152  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.71 
 
 
1666 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
861 aa  149  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
864 aa  148  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  27.99 
 
 
546 aa  148  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.78 
 
 
737 aa  147  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.58 
 
 
794 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.18 
 
 
797 aa  147  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 
494 aa  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>