More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6170 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  33.51 
 
 		 1833 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  63.73 
 
 		 1685 aa  1994    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  34.66 
 
 		 1809 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.28 
 
 		 1822 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.93 
 
 		 1668 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  34.65 
 
 		 1697 aa  820    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.38 
 
 		 1663 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 		 1748 aa  3475    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  35.67 
 
 		 1837 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  34.81 
 
 		 1712 aa  831    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  64.03 
 
 		 1685 aa  1998    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.43 
 
 		 1845 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  34 
 
 		 1836 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 1744 aa  614  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  30.63 
 
 		 1682 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  31.9 
 
 		 1710 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  30.39 
 
 		 1682 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.54 
 
 		 1780 aa  599  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  30.08 
 
 		 1685 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.86 
 
 		 2051 aa  586  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.91 
 
 		 1808 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.77 
 
 		 1804 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  30.15 
 
 		 2303 aa  569  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.04 
 
 		 1805 aa  562  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.51 
 
 		 1797 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.65 
 
 		 1795 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 1932 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.3 
 
 		 1850 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.91 
 
 		 1774 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.7 
 
 		 1794 aa  546  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 		 1914 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 		 1805 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  27.55 
 
 		 2279 aa  534  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  27 
 
 		 2077 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2272 aa  525  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  29.22 
 
 		 2361 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.34 
 
 		 1901 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 		 1908 aa  516  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  27.98 
 
 		 1922 aa  516  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  29.77 
 
 		 1885 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 1644 aa  489  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.06 
 
 		 1780 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.16 
 
 		 2109 aa  482  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  25.87 
 
 		 1934 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.11 
 
 		 1871 aa  453  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.85 
 
 		 2017 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.23 
 
 		 1832 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  28.97 
 
 		 1756 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 470 aa  344  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 470 aa  341  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 1942 aa  336  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.5 
 
 		 1788 aa  333  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.68 
 
 		 1739 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  27.07 
 
 		 1811 aa  317  9e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 		 1637 aa  302  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  28.58 
 
 		 1636 aa  301  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 1123 aa  301  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 		 1629 aa  285  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 1643 aa  279  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 670 aa  271  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.08 
 
 		 1797 aa  263  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.07 
 
 		 1885 aa  254  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 427 aa  249  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 		 1649 aa  209  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 1726 aa  207  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.06 
 
 		 1060 aa  202  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 		 1473 aa  193  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.31 
 
 		 1473 aa  191  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 729 aa  191  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.31 
 
 		 1473 aa  191  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 733 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 1235 aa  180  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 640 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 779 aa  175  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  26.66 
 
 		 1377 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 657 aa  171  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 773 aa  170  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 632 aa  170  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 636 aa  170  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 632 aa  170  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 632 aa  170  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 666 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  23.63 
 
 		 1064 aa  169  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 494 aa  168  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 713 aa  168  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 739 aa  167  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  40.25 
 
 		 356 aa  165  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 748 aa  163  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 851 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  20.32 
 
 		 1112 aa  160  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 803 aa  157  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  25.23 
 
 		 1774 aa  157  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 471 aa  157  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  36.32 
 
 		 406 aa  155  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 495 aa  150  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 1000 aa  150  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 515 aa  148  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 963 aa  147  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 484 aa  147  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 839 aa  147  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>