More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3813 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
978 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
963 aa  1945    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.53 
 
 
975 aa  847    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.86 
 
 
1301 aa  364  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
979 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 
837 aa  341  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
1131 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  32.7 
 
 
1299 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
1358 aa  301  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  38.57 
 
 
816 aa  290  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  37.84 
 
 
816 aa  279  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
1287 aa  250  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
1140 aa  243  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.66 
 
 
1845 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  31.16 
 
 
1427 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.57 
 
 
1152 aa  232  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1426 aa  230  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.99 
 
 
1378 aa  230  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  31.09 
 
 
1306 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
1153 aa  227  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 
904 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
1385 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
1010 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
1415 aa  224  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
1711 aa  224  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  32.06 
 
 
1366 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
1118 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1559 aa  221  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
1002 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  30.53 
 
 
1202 aa  218  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
1431 aa  217  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  32.6 
 
 
1373 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.6 
 
 
1514 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
1361 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
1383 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.6 
 
 
1514 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.02 
 
 
1344 aa  214  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.53 
 
 
1156 aa  214  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
1390 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  33.12 
 
 
1311 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  36.8 
 
 
1833 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  33.33 
 
 
1347 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  38.52 
 
 
919 aa  211  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
1048 aa  210  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1390 aa  210  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1390 aa  210  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  32.13 
 
 
1400 aa  208  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  31.8 
 
 
1298 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  34.66 
 
 
1343 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  30.56 
 
 
1366 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.56 
 
 
1051 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1651 aa  204  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  32.33 
 
 
1374 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  33.85 
 
 
876 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
1003 aa  202  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  34.44 
 
 
1344 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.73 
 
 
1418 aa  201  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  34.99 
 
 
1172 aa  200  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  30.94 
 
 
1363 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
636 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
1180 aa  199  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  33.33 
 
 
1378 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1646 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1406 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  32.24 
 
 
1384 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
1631 aa  197  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
1013 aa  195  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  30.93 
 
 
1370 aa  195  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
773 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  31.57 
 
 
1341 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 
934 aa  194  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  42.67 
 
 
355 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
739 aa  193  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
515 aa  192  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  30.07 
 
 
1335 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
553 aa  191  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.06 
 
 
1340 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.42 
 
 
961 aa  189  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  34.67 
 
 
1837 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1248 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  31.84 
 
 
1355 aa  188  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
495 aa  187  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
640 aa  187  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
677 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
851 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  32.88 
 
 
663 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
500 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 
1349 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
632 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
632 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
632 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
1370 aa  185  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  30.34 
 
 
1373 aa  184  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  41.38 
 
 
355 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  42.68 
 
 
1822 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  39.59 
 
 
406 aa  182  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1274 aa  182  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
1645 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
471 aa  181  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
1383 aa  181  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>