More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1683 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  30.36 
 
 
2303 aa  830    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.16 
 
 
1774 aa  816    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.84 
 
 
1780 aa  760    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  50.08 
 
 
1845 aa  1711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.49 
 
 
2279 aa  810    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  34.45 
 
 
2361 aa  967    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.56 
 
 
1780 aa  971    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.18 
 
 
1901 aa  924    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.93 
 
 
1805 aa  909    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  33.45 
 
 
1934 aa  997    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.86 
 
 
1668 aa  973    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.2 
 
 
1804 aa  952    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.33 
 
 
2017 aa  891    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.07 
 
 
1794 aa  885    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  33.77 
 
 
1850 aa  918    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.97 
 
 
1797 aa  978    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.7 
 
 
1795 aa  956    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.94 
 
 
1808 aa  893    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  32.45 
 
 
1871 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
1644 aa  680    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
1914 aa  918    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  42.6 
 
 
1822 aa  1341    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  36.89 
 
 
2051 aa  958    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  40.56 
 
 
1697 aa  994    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  42.57 
 
 
1836 aa  1354    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.82 
 
 
1885 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  31.68 
 
 
2077 aa  908    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  42.21 
 
 
1809 aa  1375    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  48.66 
 
 
1837 aa  1635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
1942 aa  985    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  30.31 
 
 
2272 aa  830    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  32.49 
 
 
2109 aa  768    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
1908 aa  931    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  39.28 
 
 
1712 aa  964    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  100 
 
 
1833 aa  3741    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  32.47 
 
 
1811 aa  832    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 
1805 aa  934    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
1932 aa  936    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  32.44 
 
 
1685 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.37 
 
 
1663 aa  967    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.67 
 
 
1922 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  32.44 
 
 
1685 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  30.44 
 
 
1739 aa  629  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.25 
 
 
1748 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.53 
 
 
1797 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  30.27 
 
 
1685 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.07 
 
 
1788 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  40.75 
 
 
670 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.07 
 
 
1832 aa  527  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  29.47 
 
 
1744 aa  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  29.58 
 
 
1682 aa  520  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  29.59 
 
 
1682 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.74 
 
 
1885 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  30.36 
 
 
1756 aa  465  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  29.6 
 
 
1710 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
1637 aa  437  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
1643 aa  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
1636 aa  426  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 
1629 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 
1649 aa  393  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
1123 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  25.3 
 
 
1064 aa  321  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
1726 aa  320  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.55 
 
 
1112 aa  316  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.32 
 
 
1060 aa  305  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  25.7 
 
 
1123 aa  295  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 
1473 aa  281  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
1473 aa  280  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
1473 aa  280  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  25.4 
 
 
1255 aa  248  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 
739 aa  240  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
851 aa  238  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
975 aa  237  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
515 aa  222  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
666 aa  220  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
978 aa  218  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
640 aa  215  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
963 aa  213  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  44.78 
 
 
355 aa  212  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
1000 aa  212  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  43.1 
 
 
406 aa  212  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  44.78 
 
 
355 aa  211  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
657 aa  211  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
680 aa  211  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
803 aa  210  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
495 aa  208  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
713 aa  207  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
662 aa  204  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
1211 aa  202  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
759 aa  202  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
636 aa  201  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
553 aa  201  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  42.74 
 
 
358 aa  201  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
902 aa  200  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
779 aa  200  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
748 aa  200  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
632 aa  197  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  41.81 
 
 
356 aa  197  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
632 aa  197  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  41.81 
 
 
357 aa  197  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>