More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6496 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.82 
 
 
1845 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  33.91 
 
 
1836 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  35.48 
 
 
1697 aa  857    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  32.34 
 
 
1833 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
1685 aa  3341    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  34.34 
 
 
1712 aa  850    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.26 
 
 
1663 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  35.86 
 
 
1837 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  35.54 
 
 
1809 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  97.39 
 
 
1685 aa  3192    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  63.73 
 
 
1748 aa  1954    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.19 
 
 
1822 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.81 
 
 
1668 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  33.06 
 
 
1744 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.84 
 
 
1780 aa  618  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  31.93 
 
 
1710 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.72 
 
 
1808 aa  592  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.54 
 
 
1850 aa  586  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.85 
 
 
1795 aa  582  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  29.87 
 
 
1685 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.38 
 
 
1774 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.99 
 
 
1805 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.39 
 
 
1804 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.13 
 
 
1797 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.63 
 
 
2051 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  30.05 
 
 
1682 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
1914 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  29.93 
 
 
1682 aa  556  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 
1932 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.61 
 
 
1901 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  26.8 
 
 
2077 aa  549  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.07 
 
 
1794 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  28.66 
 
 
2303 aa  543  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  30.08 
 
 
2361 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  25.62 
 
 
1805 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
1908 aa  532  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
1942 aa  516  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
1644 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.64 
 
 
1934 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  29.28 
 
 
1922 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  26.64 
 
 
2279 aa  503  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.22 
 
 
2272 aa  493  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.9 
 
 
1780 aa  489  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.36 
 
 
2017 aa  469  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.8 
 
 
1871 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.23 
 
 
2109 aa  439  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.67 
 
 
1832 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.08 
 
 
1885 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.85 
 
 
1756 aa  348  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 
470 aa  335  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.84 
 
 
470 aa  333  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152454  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.51 
 
 
1788 aa  328  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  27.08 
 
 
1811 aa  318  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.44 
 
 
1739 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
1123 aa  314  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.59 
 
 
1885 aa  302  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
670 aa  292  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
1637 aa  273  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.28 
 
 
1636 aa  271  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
427 aa  268  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
1643 aa  264  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
1629 aa  251  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.74 
 
 
1797 aa  244  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  28.56 
 
 
1649 aa  205  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 
1473 aa  195  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.2 
 
 
1473 aa  192  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.2 
 
 
1473 aa  192  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 
1726 aa  192  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
733 aa  190  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
640 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
632 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.28 
 
 
1064 aa  184  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
632 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
632 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
729 aa  183  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
494 aa  183  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  23.79 
 
 
1060 aa  177  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
495 aa  176  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
779 aa  172  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  43.35 
 
 
356 aa  172  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
773 aa  171  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
963 aa  171  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
666 aa  171  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  20.65 
 
 
1112 aa  170  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
636 aa  166  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
803 aa  165  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
484 aa  164  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
739 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
657 aa  158  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  26 
 
 
1377 aa  157  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
471 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
713 aa  156  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
851 aa  154  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4635  histidine kinase  37.89 
 
 
440 aa  154  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal  0.951565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
355 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
839 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
635 aa  151  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
1211 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  36.48 
 
 
406 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
1211 aa  150  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>