More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5459 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  86.79 
 
 
1211 aa  2155    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1211 aa  2455    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.27 
 
 
902 aa  879    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
1000 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
886 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
636 aa  386  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
875 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
657 aa  350  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
759 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
515 aa  301  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
729 aa  290  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
713 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
733 aa  281  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
773 aa  251  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
796 aa  249  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
975 aa  238  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
632 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
632 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
632 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
1002 aa  231  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
803 aa  226  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
779 aa  219  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.99 
 
 
1822 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.87 
 
 
1331 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
1059 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
902 aa  209  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.68 
 
 
1432 aa  204  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 
851 aa  203  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  45.2 
 
 
355 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
484 aa  202  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
494 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
1057 aa  199  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  46.03 
 
 
355 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  44.26 
 
 
1845 aa  197  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 
1138 aa  196  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 
1011 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3055  putative PAS/PAC sensor protein  31.05 
 
 
561 aa  195  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  38.82 
 
 
1833 aa  194  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
513 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
871 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
1002 aa  192  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.09 
 
 
878 aa  192  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
519 aa  192  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
870 aa  191  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
640 aa  191  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 
1076 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
841 aa  189  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.32 
 
 
1418 aa  189  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  46.85 
 
 
225 aa  188  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  26.87 
 
 
1065 aa  187  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
680 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  39.58 
 
 
406 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
512 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
511 aa  186  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
838 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
838 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
838 aa  185  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
508 aa  185  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
838 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
838 aa  184  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
515 aa  184  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
941 aa  184  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
838 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  28.71 
 
 
512 aa  183  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
838 aa  184  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  36.05 
 
 
1837 aa  183  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
838 aa  183  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
666 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
748 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
739 aa  182  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.16 
 
 
857 aa  180  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 
1297 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  23.02 
 
 
1020 aa  180  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
662 aa  179  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
1065 aa  179  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 
1171 aa  179  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
526 aa  179  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  39 
 
 
357 aa  179  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
1171 aa  179  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
842 aa  178  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
841 aa  178  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
524 aa  178  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
885 aa  178  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
858 aa  178  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
885 aa  178  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
879 aa  177  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
879 aa  177  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
835 aa  177  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
835 aa  177  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  30.52 
 
 
835 aa  177  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  31.86 
 
 
846 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
503 aa  177  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
495 aa  177  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  24.8 
 
 
1086 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.51 
 
 
955 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
351 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
799 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
527 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  40.96 
 
 
382 aa  175  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.51 
 
 
1927 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>