More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5522 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 875 aa  1775    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.67 
 
 		 886 aa  1006    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 1000 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 		 657 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 		 713 aa  475  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 1211 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 796 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 		 759 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 1211 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 		 733 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 902 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 729 aa  361  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 803 aa  312  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 		 515 aa  297  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 640 aa  286  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 773 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 484 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  47.23 
 
 		 1845 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 		 975 aa  210  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  46.53 
 
 		 355 aa  210  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 739 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  43.78 
 
 		 355 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  43.04 
 
 		 1697 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  43.67 
 
 		 406 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 851 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 632 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.46 
 
 		 1822 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 632 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 632 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  40.96 
 
 		 1837 aa  194  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  44.94 
 
 		 356 aa  194  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  41.35 
 
 		 1712 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 427 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  37.68 
 
 		 1833 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 1002 aa  189  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1002 aa  188  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  48.65 
 
 		 225 aa  188  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 		 1342 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  41.06 
 
 		 357 aa  185  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  42.21 
 
 		 358 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7271  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 		 540 aa  180  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.839285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  26.72 
 
 		 1065 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 845 aa  178  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 1002 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 1171 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  41.52 
 
 		 382 aa  174  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 494 aa  173  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 351 aa  173  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 471 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.8 
 
 		 878 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 902 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  28.73 
 
 		 1561 aa  171  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  27.66 
 
 		 1041 aa  171  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 1171 aa  171  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.48 
 
 		 1391 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 1016 aa  171  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 955 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 513 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 963 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 666 aa  169  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 527 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 799 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 662 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 511 aa  165  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1065 aa  165  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 745 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 515 aa  165  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 1001 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 513 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 1927 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 495 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  38.93 
 
 		 1710 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 1331 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  29.14 
 
 		 879 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  29.14 
 
 		 879 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 838 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  29.14 
 
 		 835 aa  162  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  29.14 
 
 		 835 aa  162  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 838 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  29.14 
 
 		 835 aa  162  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  29.14 
 
 		 885 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  29.14 
 
 		 885 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 838 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 838 aa  161  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  28.9 
 
 		 846 aa  160  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 978 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 838 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.76 
 
 		 1363 aa  160  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 616 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 838 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 519 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 2693 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.78 
 
 		 1418 aa  159  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 838 aa  159  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>