More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2116 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
524 aa  1046    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  83.51 
 
 
526 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  79.95 
 
 
527 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 
634 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.58 
 
 
630 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.31 
 
 
501 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.08 
 
 
631 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.53 
 
 
509 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 
514 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.78 
 
 
513 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.85 
 
 
519 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.34 
 
 
500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.74 
 
 
510 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.71 
 
 
515 aa  465  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 
494 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.53 
 
 
503 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  57.89 
 
 
511 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.36 
 
 
513 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.47 
 
 
457 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.11 
 
 
534 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53 
 
 
510 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.76 
 
 
508 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.66 
 
 
501 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.13 
 
 
512 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.26 
 
 
515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  53.02 
 
 
512 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 
608 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
379 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
398 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.47 
 
 
461 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
851 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
692 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
632 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
473 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 
471 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  31.8 
 
 
812 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
743 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.25 
 
 
823 aa  230  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49 
 
 
472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.816658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
651 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
662 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
680 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
520 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
902 aa  210  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
642 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
1291 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
653 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
643 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
708 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2452  multisensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
799 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
885 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
846 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
642 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
660 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
885 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
879 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
879 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
835 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
835 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  30.57 
 
 
835 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  30.2 
 
 
699 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
845 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  29 
 
 
678 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  33.25 
 
 
1255 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
838 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
838 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  30.48 
 
 
650 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
810 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
838 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
773 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
838 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
666 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.71 
 
 
857 aa  188  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
838 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
662 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
698 aa  188  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
838 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
838 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
838 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2015  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
538 aa  187  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  32.49 
 
 
811 aa  187  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
871 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
858 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
842 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
841 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
733 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
841 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
857 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
697 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2568  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
661 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.957334  normal  0.86605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0909  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
661 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
639 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
650 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>