More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3892 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
512 aa  1026    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  82.19 
 
 
515 aa  824    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  72.84 
 
 
519 aa  715    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  82 
 
 
512 aa  823    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  67.82 
 
 
513 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.45 
 
 
526 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.64 
 
 
527 aa  571  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.44 
 
 
494 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.91 
 
 
513 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.77 
 
 
503 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 
511 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.95 
 
 
508 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 
510 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.44 
 
 
510 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.7 
 
 
630 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  63.64 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.13 
 
 
524 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.6 
 
 
457 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.57 
 
 
500 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.12 
 
 
515 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.99 
 
 
534 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 
634 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 
514 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.24 
 
 
631 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
509 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 
608 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 
379 aa  343  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
851 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
692 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 
461 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
673 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 
473 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 
471 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
472 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.816658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  29.31 
 
 
1255 aa  216  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
773 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  33.73 
 
 
823 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
553 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
666 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
902 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
632 aa  200  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
1291 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
680 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  27.48 
 
 
1629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  34.62 
 
 
1833 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
1211 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.88 
 
 
857 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
799 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
698 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
487 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  42.64 
 
 
879 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  42.64 
 
 
885 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  42.64 
 
 
879 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  42.47 
 
 
846 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
902 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  42.64 
 
 
885 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  42.47 
 
 
835 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  42.47 
 
 
835 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  42.47 
 
 
835 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
838 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
662 aa  183  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
841 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2452  multisensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
556 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.81 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
632 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
733 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
632 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
632 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
845 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
871 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
841 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
858 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
636 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
499 aa  180  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
886 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
842 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
975 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
838 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
1211 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
838 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
707 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3366  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
716 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
683 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  32.31 
 
 
1837 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
708 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
838 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
748 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
838 aa  177  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
838 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
838 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4653  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.99 
 
 
709 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
870 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
713 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
838 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4016  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
716 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
875 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>