More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1195 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  58.42 
 
 
835 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  58.42 
 
 
885 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  79.7 
 
 
857 aa  1320    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  77.28 
 
 
858 aa  1345    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.57 
 
 
838 aa  964    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  58.42 
 
 
879 aa  966    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.7 
 
 
838 aa  967    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  89.47 
 
 
871 aa  1590    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  81.27 
 
 
842 aa  1345    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  58.42 
 
 
879 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.57 
 
 
838 aa  965    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
857 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
848 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.664527  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.05 
 
 
841 aa  958    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  58.66 
 
 
846 aa  973    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
846 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
862 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
873 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0861202  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 
857 aa  669    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 
841 aa  979    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
870 aa  1788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1645  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
810 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
845 aa  683    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0810932  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.43 
 
 
838 aa  966    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 
862 aa  715    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
856 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00464627  hitchhiker  0.00534062 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  58.42 
 
 
835 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
848 aa  678    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  58.42 
 
 
885 aa  967    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.44 
 
 
838 aa  964    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.55 
 
 
838 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  58.42 
 
 
835 aa  968    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.82 
 
 
838 aa  965    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.45 
 
 
838 aa  977    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
848 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
799 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
902 aa  479  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
662 aa  280  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
680 aa  224  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
848 aa  208  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4016  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
716 aa  202  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3366  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
716 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
608 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
503 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  45.42 
 
 
630 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
501 aa  187  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
707 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
514 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  33.49 
 
 
811 aa  184  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
519 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
510 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
510 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
634 aa  181  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
524 aa  181  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 
508 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
630 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
1211 aa  178  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
683 aa  177  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219035  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
494 aa  177  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
689 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
708 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
513 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
1211 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0909  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
661 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2568  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
661 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.957334  normal  0.86605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
515 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0244  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
661 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  30.39 
 
 
512 aa  171  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
553 aa  171  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
710 aa  171  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
632 aa  171  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4653  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.96 
 
 
709 aa  170  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
698 aa  170  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
511 aa  168  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
517 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121582  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2499  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
521 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0406427  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3682  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
685 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00804168  normal  0.462115 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
733 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
509 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.077767 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
500 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
902 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
773 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
527 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
659 aa  163  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
975 aa  163  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
631 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
517 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3616  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
515 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.766527  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3904  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
490 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
748 aa  163  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
461 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
636 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
498 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
515 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
503 aa  159  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>