More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1517 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
632 aa  1250    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  67.72 
 
 
635 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
666 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
640 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
733 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 
632 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 
632 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 
632 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
839 aa  199  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
729 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
495 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
851 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  35.37 
 
 
1833 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
975 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
739 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
748 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  39.79 
 
 
1837 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
871 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
759 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
870 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  41.96 
 
 
1845 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
369 aa  181  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
484 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
713 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
634 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
1211 aa  177  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
471 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.86 
 
 
1822 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
1211 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
636 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
773 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  34.92 
 
 
406 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
519 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
631 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
500 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  36.82 
 
 
355 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
501 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.6 
 
 
857 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
657 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
902 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4635  histidine kinase  32.87 
 
 
440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal  0.951565 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7271  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.839285 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
1000 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
803 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
875 aa  163  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
680 aa  163  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  37.75 
 
 
382 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  38.53 
 
 
355 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
779 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  35.85 
 
 
357 aa  162  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
513 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
978 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
503 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
512 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
858 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
842 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
1267 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
886 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
845 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
524 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  37.9 
 
 
225 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  40.17 
 
 
1744 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
608 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5184  histidine kinase  32.21 
 
 
435 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
494 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
515 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
398 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  36.67 
 
 
1836 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  30.88 
 
 
512 aa  154  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
745 aa  154  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
351 aa  153  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
662 aa  153  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  39.84 
 
 
630 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
457 aa  153  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
963 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
902 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  37.85 
 
 
358 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
602 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
526 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
503 aa  151  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
527 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  27.27 
 
 
885 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  27.71 
 
 
846 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
510 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  27.27 
 
 
885 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  27.27 
 
 
835 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  27.27 
 
 
879 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  27.27 
 
 
879 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  27.27 
 
 
835 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  27.27 
 
 
835 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
841 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  33.81 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  35.86 
 
 
1710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  33.96 
 
 
1712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>