More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1744 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  100 
 
 		 630 aa  1253    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2490  sensor histidine kinase  46.09 
 
 		 600 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1417  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 626 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2089  histidine kinase  30.42 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0535  histidine kinase  31.91 
 
 		 602 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3040  histidine kinase  32.07 
 
 		 594 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1970  histidine kinase  32.01 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.12135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0479  histidine kinase  33.27 
 
 		 603 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4155  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 601 aa  259  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0452  histidine kinase  31.68 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0468  histidine kinase  33.09 
 
 		 603 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3861  histidine kinase  32.02 
 
 		 603 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 613 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003035  tetrathionate reductase sensory transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 607 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2281  histidine kinase  32.06 
 
 		 558 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.278764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3696  histidine kinase  31.36 
 
 		 592 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0437  histidine kinase  31.63 
 
 		 607 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3516  histidine kinase  31.54 
 
 		 607 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.295368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1066  histidine kinase  33.75 
 
 		 585 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3182  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0636  ATPase domain-containing protein  31.59 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3733  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 645 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3676  histidine kinase  30.59 
 
 		 682 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 644 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0665  histidine kinase  30.74 
 
 		 670 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2451  putative diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 651 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0636  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 682 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3859  histidine kinase  29.97 
 
 		 671 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1998  histidine kinase  27.23 
 
 		 617 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2400  sensor histidine kinase  31.61 
 
 		 608 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774596  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1483  sensor-kinase  31.15 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  0.317682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1499  sensor-kinase  30.92 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000587634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1520  sensor-kinase  30.92 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1785  sensor-kinase  30.92 
 
 		 582 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1956  sensor-kinase  30.74 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2451  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.03 
 
 		 802 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0900  sensor kinase  25.85 
 
 		 565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 871 aa  195  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 763 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0337162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  44.06 
 
 		 857 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 858 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 870 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 842 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 662 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 879 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 885 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 879 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 835 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 835 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 885 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 835 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.65 
 
 		 1082 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  42.02 
 
 		 846 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 732 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 379 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 838 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 838 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1287 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 902 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 512 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 841 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 841 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 838 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 680 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 498 aa  169  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 851 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 748 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0356  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.02 
 
 		 667 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.589026  normal  0.448313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 630 aa  164  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 513 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 845 aa  163  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0810932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 510 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 515 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 534 aa  163  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 799 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  30.43 
 
 		 1028 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 666 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 494 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1833  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 687 aa  160  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 527 aa  160  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.01 
 
 		 1038 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 862 aa  158  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 636 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>