More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3696 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4155  sensor histidine kinase  93.41 
 
 		 601 aa  1148    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.9 
 
 		 626 aa  795    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0479  histidine kinase  89.7 
 
 		 603 aa  1108    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0452  histidine kinase  90.86 
 
 		 603 aa  1116    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0535  histidine kinase  89.64 
 
 		 602 aa  1079    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0468  histidine kinase  89.7 
 
 		 603 aa  1109    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3861  histidine kinase  89.7 
 
 		 603 aa  1109    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3516  histidine kinase  94.92 
 
 		 607 aa  1168    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.295368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0437  histidine kinase  94.26 
 
 		 607 aa  1159    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.5 
 
 		 613 aa  820    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3696  histidine kinase  100 
 
 		 592 aa  1225    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3182  sensor histidine kinase  57.26 
 
 		 609 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3040  histidine kinase  51.53 
 
 		 594 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1998  histidine kinase  52.81 
 
 		 617 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003035  tetrathionate reductase sensory transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 607 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0665  histidine kinase  36.62 
 
 		 670 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3676  histidine kinase  36.33 
 
 		 682 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 644 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307601  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3733  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 645 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0636  ATPase domain-containing protein  36.88 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3859  histidine kinase  36 
 
 		 671 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0636  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 682 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1066  histidine kinase  31.76 
 
 		 585 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1785  sensor-kinase  32.68 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1499  sensor-kinase  32.25 
 
 		 582 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000587634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1520  sensor-kinase  32.25 
 
 		 582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1956  sensor-kinase  32.25 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1483  sensor-kinase  31.47 
 
 		 582 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  0.317682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2089  histidine kinase  29.19 
 
 		 596 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1417  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  31.18 
 
 		 630 aa  240  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0900  sensor kinase  28.77 
 
 		 565 aa  239  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1970  histidine kinase  28.93 
 
 		 576 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.12135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2490  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 600 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2281  histidine kinase  28.55 
 
 		 558 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.278764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2400  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 608 aa  211  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774596  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1439  Signal transduction histidine kinase sensor  26.29 
 
 		 713 aa  195  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2451  putative diguanylate cyclase  28.87 
 
 		 651 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 763 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0337162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2451  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.54 
 
 		 802 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 1287 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 871 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 732 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 870 aa  135  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.85 
 
 		 1082 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 858 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 842 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1645  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 810 aa  130  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 845 aa  130  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0810932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 862 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508108  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.1 
 
 		 857 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  30.79 
 
 		 1028 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.27 
 
 		 1038 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.04 
 
 		 932 aa  124  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 862 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 848 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.664527  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 		 963 aa  124  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  32.09 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 841 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 838 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 856 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00464627  hitchhiker  0.00534062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 841 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 733 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 857 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 873 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0861202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 857 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0356  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.47 
 
 		 667 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.589026  normal  0.448313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 680 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  30.65 
 
 		 846 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 461 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 846 aa  117  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  31.03 
 
 		 885 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  30.27 
 
 		 835 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  30.27 
 
 		 879 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  30.27 
 
 		 835 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  30.27 
 
 		 879 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  31.03 
 
 		 885 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  30.27 
 
 		 835 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 838 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 975 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 848 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 838 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 708 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 848 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 838 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 838 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3050  PAS sensor protein  29.79 
 
 		 653 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 838 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 838 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 838 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 902 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 963 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>