More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2161 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 885 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  45.9 
 
 		 857 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.37 
 
 		 848 aa  1186    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 879 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 835 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 871 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 879 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 842 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1471  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 841 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 838 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  67.63 
 
 		 848 aa  1141    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.664527  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 835 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 846 aa  1726    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 846 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.31 
 
 		 862 aa  1117    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.06 
 
 		 873 aa  1175    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0861202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  66.19 
 
 		 857 aa  1118    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 		 841 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  68.37 
 
 		 848 aa  1186    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 870 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 885 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 838 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 835 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 838 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 		 838 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  67.61 
 
 		 857 aa  1157    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 858 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 838 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 		 838 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1645  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 810 aa  891    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 		 838 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.11 
 
 		 856 aa  1114    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00464627  hitchhiker  0.00534062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.76 
 
 		 838 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2129  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.61 
 
 		 862 aa  929    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0772387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 845 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0810932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 799 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 902 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 680 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 662 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 630 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 631 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 514 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 634 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 608 aa  174  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4830  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 848 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.508218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 524 aa  171  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 707 aa  170  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 513 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 710 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 519 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 727 aa  168  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2568  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 661 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.957334  normal  0.86605 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3366  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 716 aa  165  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0909  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 661 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.310959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4016  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 716 aa  164  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  34.72 
 
 		 811 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 501 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 503 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 683 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 689 aa  163  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 975 aa  162  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 509 aa  162  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 1000 aa  161  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4653  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.63 
 
 		 709 aa  160  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 500 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 692 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 495 aa  160  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 515 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 708 aa  159  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 471 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 473 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 513 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 494 aa  157  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 902 aa  157  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 698 aa  157  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 553 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 508 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0244  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 661 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 511 aa  154  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 1211 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1551  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 529 aa  153  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 534 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 676 aa  151  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10947  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 636 aa  151  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 457 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 1061 aa  149  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 501 aa  149  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  35.43 
 
 		 406 aa  149  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 851 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3040  histidine kinase  32.47 
 
 		 594 aa  148  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 379 aa  147  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 515 aa  147  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 512 aa  147  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  40.34 
 
 		 512 aa  146  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>