More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0812 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
978 aa  864    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.42 
 
 
963 aa  810    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
975 aa  1979    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
979 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.09 
 
 
1301 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 
837 aa  338  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  41.53 
 
 
816 aa  335  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
1131 aa  334  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  41.91 
 
 
816 aa  332  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
1358 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
1140 aa  309  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
1299 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
1118 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
1287 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  39.15 
 
 
1427 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
1426 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
1415 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
1711 aa  269  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.87 
 
 
1514 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
1385 aa  268  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.67 
 
 
1514 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
1361 aa  266  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.86 
 
 
1152 aa  266  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
1383 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
1153 aa  261  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1431 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1559 aa  257  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
1048 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
1002 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 
1406 aa  254  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
1370 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
1383 aa  253  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
1651 aa  251  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  32.46 
 
 
1306 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
1202 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
1390 aa  244  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1631 aa  243  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.14 
 
 
1180 aa  243  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  48.29 
 
 
355 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
1010 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.7 
 
 
876 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
1248 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.65 
 
 
1366 aa  241  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
1390 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
1211 aa  240  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
1390 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
1646 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  48.29 
 
 
355 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.79 
 
 
1051 aa  238  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  36.83 
 
 
1833 aa  237  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  35.12 
 
 
919 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.89 
 
 
1378 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
1211 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  36.43 
 
 
1343 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.11 
 
 
1845 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
1013 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  53.85 
 
 
225 aa  235  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
1003 aa  234  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 
1156 aa  233  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.11 
 
 
1384 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 
904 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  33.65 
 
 
1373 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.86 
 
 
1347 aa  226  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 
1172 aa  226  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  33.49 
 
 
1311 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
902 aa  224  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  35.86 
 
 
1344 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
1645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  31.6 
 
 
1418 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 
934 aa  219  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  44.87 
 
 
406 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
713 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
636 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.22 
 
 
1374 aa  217  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
851 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
553 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
886 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.79 
 
 
663 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1274 aa  214  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  30.39 
 
 
1370 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  29.66 
 
 
1373 aa  213  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30.88 
 
 
1344 aa  212  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  45.93 
 
 
1822 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
739 aa  211  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  31.54 
 
 
1335 aa  211  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
875 aa  210  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
1000 aa  210  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  31.7 
 
 
1378 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  27.92 
 
 
1046 aa  209  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  30.56 
 
 
1400 aa  208  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
640 aa  207  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 
733 aa  207  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
677 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  31.42 
 
 
1355 aa  205  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  30.75 
 
 
1366 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
803 aa  204  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 
1349 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 
940 aa  204  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
796 aa  204  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
662 aa  203  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>