More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2886 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
640 aa  1308    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7271  putative PAS/PAC sensor protein  63.15 
 
 
540 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.839285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
733 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
666 aa  316  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
657 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
632 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
632 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
632 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
729 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
713 aa  303  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
875 aa  286  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
635 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
886 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
484 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
1000 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
759 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
632 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
779 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
803 aa  253  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
796 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
739 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.77 
 
 
1822 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  42.8 
 
 
356 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  38.94 
 
 
1833 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
495 aa  214  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  40.93 
 
 
1845 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  42.13 
 
 
1712 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
975 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
851 aa  205  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  39.62 
 
 
1837 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
902 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
748 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  44.44 
 
 
355 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  39.21 
 
 
1744 aa  201  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  44.44 
 
 
355 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  40.25 
 
 
357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  37.67 
 
 
1836 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
1267 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  37.63 
 
 
1710 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
839 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
636 aa  195  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
427 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
471 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  41.18 
 
 
1697 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
1211 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  42.67 
 
 
358 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
351 aa  190  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
1211 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
963 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
745 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
773 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7250  histidine kinase  63.64 
 
 
154 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  37.61 
 
 
406 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
494 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
616 aa  183  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
503 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  43.33 
 
 
1685 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  42.92 
 
 
1685 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  38.17 
 
 
382 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
515 aa  180  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
513 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
511 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  38.91 
 
 
356 aa  177  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
1060 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  36.9 
 
 
1682 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  36.59 
 
 
1685 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  36.9 
 
 
1682 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.94 
 
 
1748 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0037  sensor histidine kinase  38.49 
 
 
337 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  37.78 
 
 
225 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
513 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
845 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
501 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
553 aa  173  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
634 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6679  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
658 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
416 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
510 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
492 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
510 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
978 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
799 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
519 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
508 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
648 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
515 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  36.36 
 
 
635 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
534 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
512 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
524 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
902 aa  163  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0515  histidine kinase  38.18 
 
 
299 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
501 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
526 aa  161  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 
631 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>