More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1563 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  44.15 
 
 
1809 aa  1234    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.75 
 
 
1774 aa  720    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  41.32 
 
 
1663 aa  1056    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
1914 aa  785    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  33.7 
 
 
2361 aa  838    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.56 
 
 
1780 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.21 
 
 
1901 aa  767    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.76 
 
 
2051 aa  849    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.99 
 
 
1805 aa  759    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  29.95 
 
 
1934 aa  855    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.06 
 
 
1804 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.77 
 
 
2017 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.68 
 
 
1794 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  30.81 
 
 
1850 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.58 
 
 
1797 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.49 
 
 
1795 aa  794    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.3 
 
 
1808 aa  780    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  40.64 
 
 
1712 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  33.36 
 
 
1908 aa  803    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  44.45 
 
 
1845 aa  1436    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  29.94 
 
 
2272 aa  775    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 
1822 aa  3697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  41.67 
 
 
1697 aa  1019    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  39.39 
 
 
1836 aa  1205    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  41.33 
 
 
1668 aa  1073    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  35.19 
 
 
1685 aa  720    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
1644 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.07 
 
 
1748 aa  685    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  45.33 
 
 
1837 aa  1449    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.27 
 
 
2279 aa  796    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  30.41 
 
 
1811 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
1805 aa  819    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
1932 aa  823    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
1942 aa  856    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  31.65 
 
 
1922 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  35.5 
 
 
1685 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  42.6 
 
 
1833 aa  1357    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  30.15 
 
 
2303 aa  794    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  29.26 
 
 
2077 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.87 
 
 
2109 aa  632  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.27 
 
 
1780 aa  617  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.08 
 
 
1797 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.48 
 
 
1871 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.18 
 
 
1739 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
1744 aa  560  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  30.55 
 
 
1685 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  30.87 
 
 
1710 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  30 
 
 
1682 aa  536  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  30.25 
 
 
1682 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  33.72 
 
 
1885 aa  502  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.93 
 
 
1788 aa  496  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  36.38 
 
 
670 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.86 
 
 
1885 aa  453  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.45 
 
 
1832 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  28.4 
 
 
1756 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 
1637 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
1123 aa  349  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
1636 aa  347  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
1643 aa  340  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1629 aa  333  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  26.43 
 
 
1064 aa  327  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
636 aa  324  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  26.07 
 
 
1060 aa  306  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
515 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
1726 aa  280  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  28.59 
 
 
1649 aa  272  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  25.83 
 
 
1112 aa  271  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
632 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
632 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
632 aa  257  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  25.56 
 
 
1473 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  25.56 
 
 
1473 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 
1473 aa  241  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
779 aa  238  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
902 aa  231  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
773 aa  231  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
657 aa  225  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 
427 aa  223  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  45.3 
 
 
406 aa  223  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
713 aa  221  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
640 aa  218  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 
739 aa  217  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  22.97 
 
 
1123 aa  216  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
1211 aa  216  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
1000 aa  216  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  47.66 
 
 
356 aa  213  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.93 
 
 
975 aa  211  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
1211 aa  210  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.19 
 
 
1255 aa  210  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 
851 aa  209  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  43.7 
 
 
355 aa  208  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
495 aa  205  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  42.44 
 
 
355 aa  205  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
484 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
803 aa  201  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
666 aa  199  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
875 aa  196  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
759 aa  193  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
538 aa  192  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  41.45 
 
 
357 aa  191  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>