More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4622 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.21 
 
 		 1845 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 2077 aa  810    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  32.66 
 
 		 2279 aa  740    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  34.62 
 
 		 1837 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 		 1780 aa  3614    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.22 
 
 		 2361 aa  891    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.2 
 
 		 1780 aa  1028    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.77 
 
 		 1901 aa  1061    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  32.66 
 
 		 2272 aa  741    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  31.38 
 
 		 2303 aa  676    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 1914 aa  806    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.5 
 
 		 1805 aa  912    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  34.08 
 
 		 1934 aa  884    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.75 
 
 		 1804 aa  996    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.33 
 
 		 2017 aa  809    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.4 
 
 		 1794 aa  942    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.27 
 
 		 1885 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  28.89 
 
 		 1871 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  32.88 
 
 		 1850 aa  1013    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.09 
 
 		 1797 aa  941    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.6 
 
 		 1795 aa  969    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33 
 
 		 1808 aa  989    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  33.91 
 
 		 1833 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.42 
 
 		 1922 aa  756    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32.39 
 
 		 1809 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.28 
 
 		 2051 aa  944    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  34.3 
 
 		 2109 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 1908 aa  920    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.48 
 
 		 1774 aa  976    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  32.05 
 
 		 1811 aa  922    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 		 1805 aa  911    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 1932 aa  939    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 1942 aa  925    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 1644 aa  628  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.58 
 
 		 1712 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  29.18 
 
 		 1697 aa  616  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.15 
 
 		 1822 aa  613  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.14 
 
 		 1668 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.87 
 
 		 1663 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.49 
 
 		 1797 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  30.82 
 
 		 1836 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  29.91 
 
 		 1756 aa  526  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  31.71 
 
 		 1788 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.02 
 
 		 1739 aa  505  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.73 
 
 		 1832 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  27.91 
 
 		 1685 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.93 
 
 		 1685 aa  483  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 1123 aa  480  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27 
 
 		 1885 aa  466  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 1744 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 		 1629 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 1636 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 1637 aa  430  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  27.08 
 
 		 1682 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  27.1 
 
 		 1685 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  27.14 
 
 		 1682 aa  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.85 
 
 		 1710 aa  383  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  27.05 
 
 		 1112 aa  332  5.0000000000000004e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 1649 aa  325  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 		 1473 aa  307  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  27.47 
 
 		 1473 aa  307  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 		 1473 aa  307  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 1643 aa  304  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  35.52 
 
 		 1726 aa  297  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  25.62 
 
 		 1060 aa  284  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 		 857 aa  276  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 873 aa  275  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 		 680 aa  268  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.52 
 
 		 1748 aa  262  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  43.48 
 
 		 1114 aa  252  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1112  histidine kinase  40.74 
 
 		 453 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0613673  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3207  histidine kinase  43.34 
 
 		 347 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00238507  normal  0.252728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  44.03 
 
 		 457 aa  248  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 494 aa  248  8e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.3 
 
 		 1064 aa  247  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.79 
 
 		 1123 aa  245  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  44.07 
 
 		 739 aa  244  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2864  histidine kinase  42.61 
 
 		 731 aa  238  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  42.07 
 
 		 695 aa  234  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.68 
 
 		 1255 aa  231  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  27.65 
 
 		 1774 aa  206  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  22.54 
 
 		 900 aa  187  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 919 aa  161  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  33.33 
 
 		 724 aa  152  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  33.11 
 
 		 730 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 664 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 427 aa  147  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 1036 aa  146  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 392 aa  145  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 763 aa  145  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2832  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 745 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  29.48 
 
 		 715 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 1072 aa  141  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  21.21 
 
 		 1086 aa  140  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 1021 aa  139  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 713 aa  139  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 688 aa  138  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.41 
 
 		 708 aa  136  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  32.17 
 
 		 671 aa  135  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>