109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45780 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  100 
 
 
1060 aa  2195    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  46.34 
 
 
1064 aa  909    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  27.89 
 
 
1850 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 
1908 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.07 
 
 
1804 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.78 
 
 
2361 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.18 
 
 
1795 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.43 
 
 
1780 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.95 
 
 
1901 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.84 
 
 
1797 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  26.33 
 
 
2077 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  27.56 
 
 
1934 aa  357  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 
1805 aa  342  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 
1942 aa  340  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.65 
 
 
1808 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 
1932 aa  339  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  26.81 
 
 
2051 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.57 
 
 
1805 aa  334  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.58 
 
 
1794 aa  332  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.63 
 
 
2017 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  25.48 
 
 
1811 aa  322  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  24.32 
 
 
1833 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  24.95 
 
 
1112 aa  302  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  25.41 
 
 
1922 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  24.23 
 
 
1871 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.2 
 
 
1914 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.49 
 
 
1774 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.85 
 
 
1663 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.52 
 
 
2303 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.62 
 
 
1780 aa  275  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.12 
 
 
2279 aa  271  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.52 
 
 
2272 aa  271  5e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.59 
 
 
1822 aa  269  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  24.07 
 
 
1809 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  25.6 
 
 
2109 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  24.21 
 
 
1697 aa  253  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.23 
 
 
1668 aa  250  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.31 
 
 
1845 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  22.82 
 
 
1123 aa  236  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 
1644 aa  229  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.03 
 
 
1255 aa  228  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  25.83 
 
 
1885 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  23.98 
 
 
1712 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  26.22 
 
 
1837 aa  218  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.58 
 
 
1797 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.62 
 
 
1739 aa  214  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  23.13 
 
 
1836 aa  208  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
1123 aa  204  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  24.09 
 
 
1710 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.2 
 
 
900 aa  173  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  23.28 
 
 
1685 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  23.49 
 
 
1685 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  24.08 
 
 
1086 aa  162  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  23.33 
 
 
1788 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  22.96 
 
 
1473 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.87 
 
 
1748 aa  160  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.96 
 
 
1473 aa  157  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.96 
 
 
1473 aa  157  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 
1643 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 
670 aa  142  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  22.49 
 
 
1682 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  22.88 
 
 
1682 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.9 
 
 
1885 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  24 
 
 
1637 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  20.72 
 
 
1015 aa  119  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 
1636 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  21.01 
 
 
1744 aa  117  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.36 
 
 
1832 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  22.31 
 
 
1685 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  21.46 
 
 
1756 aa  107  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  23.78 
 
 
1649 aa  104  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  22.1 
 
 
1629 aa  94  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
1726 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  23.1 
 
 
1022 aa  75.5  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.14 
 
 
1134 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.15 
 
 
1422 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  21.97 
 
 
1190 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.2 
 
 
1067 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  21.88 
 
 
1193 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  23.45 
 
 
1094 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  22.19 
 
 
1142 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  19.28 
 
 
2312 aa  59.3  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  22.57 
 
 
859 aa  58.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  22.32 
 
 
864 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  22.79 
 
 
1160 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  23.9 
 
 
862 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.27 
 
 
1141 aa  51.2  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  24.51 
 
 
1013 aa  51.2  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  19.53 
 
 
1015 aa  51.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  20.22 
 
 
974 aa  51.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  24.22 
 
 
867 aa  50.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  22.39 
 
 
954 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.83 
 
 
1089 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  24.6 
 
 
937 aa  50.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  21.76 
 
 
1020 aa  49.7  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  23.69 
 
 
948 aa  49.7  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  24.9 
 
 
758 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.18 
 
 
1291 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  22.85 
 
 
1377 aa  48.9  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  26.6 
 
 
981 aa  48.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>