More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2194 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 937 aa  1774    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 954 aa  294  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  34.99 
 
 		 992 aa  271  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 967 aa  258  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  31.09 
 
 		 1006 aa  250  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 983 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 973 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 		 900 aa  197  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  33.55 
 
 		 981 aa  193  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 		 1005 aa  191  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.32 
 
 		 1013 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 1084 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  36.58 
 
 		 993 aa  184  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 970 aa  171  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 999 aa  168  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 953 aa  163  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  33.79 
 
 		 982 aa  145  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  34.11 
 
 		 967 aa  133  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 895 aa  132  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  35.81 
 
 		 964 aa  125  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.35 
 
 		 1123 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.45 
 
 		 1175 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 1020 aa  108  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 881 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  34.12 
 
 		 1029 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 1022 aa  101  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 864 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  30.59 
 
 		 862 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.85 
 
 		 1422 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  28.13 
 
 		 1697 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 1403 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.43 
 
 		 1774 aa  98.2  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.77 
 
 		 1291 aa  97.8  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.63 
 
 		 1227 aa  97.8  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  28.37 
 
 		 1712 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.58 
 
 		 1055 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 1190 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 1198 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 		 1160 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.25 
 
 		 1054 aa  95.5  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.46 
 
 		 1668 aa  95.1  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 965 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  51.15 
 
 		 916 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.55 
 
 		 1122 aa  94  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 867 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 		 1398 aa  92.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.23 
 
 		 1663 aa  91.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.15 
 
 		 1871 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.45 
 
 		 1075 aa  91.3  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 		 1048 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.64 
 
 		 1123 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.65 
 
 		 1295 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  23.46 
 
 		 1123 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 1311 aa  90.1  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.95 
 
 		 1121 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 1105 aa  88.6  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.85 
 
 		 1029 aa  88.2  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.47 
 
 		 1055 aa  88.2  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.24 
 
 		 1748 aa  87.8  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  22.62 
 
 		 1908 aa  87.8  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.27 
 
 		 1403 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.21 
 
 		 1067 aa  87  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 1161 aa  87  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 		 1429 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30 
 
 		 1193 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.26 
 
 		 1134 aa  85.5  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 975 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.23 
 
 		 2279 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1298 aa  84.7  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 1007 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.15 
 
 		 1126 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 1118 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.66 
 
 		 1805 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.44 
 
 		 713 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.74 
 
 		 1034 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.2 
 
 		 1780 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.28 
 
 		 1685 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.95 
 
 		 1377 aa  82.4  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  33.13 
 
 		 957 aa  82.4  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  32.19 
 
 		 1071 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  29.33 
 
 		 1132 aa  82  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.82 
 
 		 1131 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  28.45 
 
 		 1051 aa  80.5  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.07 
 
 		 1114 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 		 1402 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  27.73 
 
 		 977 aa  80.9  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 		 1043 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 1089 aa  80.5  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 1015 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 		 1037 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  29.8 
 
 		 1685 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 		 927 aa  79.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.16 
 
 		 1850 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.35 
 
 		 1441 aa  79  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 		 1093 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.39 
 
 		 2303 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  28.85 
 
 		 1264 aa  79  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  33.63 
 
 		 963 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 1050 aa  77.8  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  30.11 
 
 		 872 aa  77.8  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>