More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1929 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 862 aa  1698    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 867 aa  525  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 895 aa  332  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  34.36 
 
 		 872 aa  324  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  30.02 
 
 		 881 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 864 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 872 aa  296  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 866 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  26.63 
 
 		 900 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.18 
 
 		 954 aa  107  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 		 970 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 983 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.74 
 
 		 916 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  26.78 
 
 		 959 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  26.93 
 
 		 982 aa  97.8  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 1013 aa  97.8  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 973 aa  94.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.25 
 
 		 1006 aa  94.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 		 992 aa  93.2  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 1089 aa  91.3  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.29 
 
 		 967 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.12 
 
 		 1029 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 		 1005 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 981 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  28.17 
 
 		 967 aa  89.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  25.13 
 
 		 993 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.78 
 
 		 2077 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  33.57 
 
 		 1054 aa  82.4  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.53 
 
 		 1071 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  49 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  32.22 
 
 		 937 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  38.19 
 
 		 2272 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 		 999 aa  78.2  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  32.92 
 
 		 1685 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 1084 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  32.62 
 
 		 1685 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 1118 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.26 
 
 		 713 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  30.23 
 
 		 1809 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.45 
 
 		 1712 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.39 
 
 		 998 aa  74.7  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 937 aa  74.7  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  30.42 
 
 		 1682 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.73 
 
 		 1114 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  24.11 
 
 		 1697 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.09 
 
 		 913 aa  73.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.71 
 
 		 1668 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.29 
 
 		 1666 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  34.72 
 
 		 2279 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  29.97 
 
 		 964 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  34.09 
 
 		 2303 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  24.4 
 
 		 1934 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  30.45 
 
 		 1682 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.14 
 
 		 1029 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  25.68 
 
 		 1022 aa  71.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  22.84 
 
 		 1850 aa  71.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.71 
 
 		 1067 aa  71.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 1320 aa  71.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 948 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.96 
 
 		 1685 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  23.44 
 
 		 1034 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.02 
 
 		 1051 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.86 
 
 		 1804 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 953 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 1141 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 1141 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27.38 
 
 		 1871 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  21.63 
 
 		 1908 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.5 
 
 		 1805 aa  68.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.71 
 
 		 214 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 781 aa  67.4  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.65 
 
 		 1663 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.34 
 
 		 2361 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 1942 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 995 aa  67  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  25.38 
 
 		 2051 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  39.58 
 
 		 929 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 1198 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.22 
 
 		 1833 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  38.93 
 
 		 956 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  28.15 
 
 		 943 aa  65.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  30.07 
 
 		 1837 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  40.45 
 
 		 940 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 1141 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  27.33 
 
 		 1109 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  33.07 
 
 		 1811 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4920  LuxR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 938 aa  65.1  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 923 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  29.29 
 
 		 1112 aa  64.7  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37 
 
 		 919 aa  64.3  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  21.89 
 
 		 1805 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 953 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.23 
 
 		 928 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 723 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.23 
 
 		 1795 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  21.89 
 
 		 1932 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 96 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 879 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>