More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4595 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
995 aa  1922    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  40.91 
 
 
917 aa  498  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  42.81 
 
 
879 aa  486  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 
940 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  41.28 
 
 
913 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.9 
 
 
923 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.4 
 
 
919 aa  362  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  35.33 
 
 
884 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 
928 aa  322  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 
909 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  34.9 
 
 
938 aa  278  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 
925 aa  270  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 
835 aa  260  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 
911 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 
910 aa  248  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 
904 aa  245  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  32.34 
 
 
928 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  33.09 
 
 
884 aa  238  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  31.81 
 
 
920 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.51 
 
 
922 aa  229  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.77 
 
 
923 aa  223  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 
918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  31.89 
 
 
923 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  32.53 
 
 
919 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  32.21 
 
 
937 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.2 
 
 
940 aa  211  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
937 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  32.21 
 
 
937 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  33.58 
 
 
892 aa  208  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 
913 aa  205  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  30.06 
 
 
929 aa  202  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  32.17 
 
 
934 aa  198  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
889 aa  194  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 
903 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  29.16 
 
 
905 aa  171  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  33.92 
 
 
930 aa  162  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  30.73 
 
 
936 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 
919 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
919 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 
919 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  29.71 
 
 
977 aa  149  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
913 aa  144  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 
928 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.35 
 
 
921 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  34.83 
 
 
916 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
921 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.14 
 
 
921 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  28.05 
 
 
900 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  34.26 
 
 
955 aa  133  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 
927 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 
953 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
950 aa  118  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.35 
 
 
961 aa  117  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  32.81 
 
 
923 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  26.6 
 
 
897 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 
946 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  33.63 
 
 
929 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  36.58 
 
 
1064 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
881 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
881 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  27.4 
 
 
893 aa  98.6  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.45 
 
 
919 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
876 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 
927 aa  95.5  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.57 
 
 
998 aa  94.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 
915 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 
929 aa  91.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 
894 aa  91.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  33.33 
 
 
240 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  33.23 
 
 
921 aa  89  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 
951 aa  85.9  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  31.23 
 
 
997 aa  84.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
877 aa  82.4  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 
974 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.74 
 
 
189 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 
998 aa  75.5  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
1000 aa  74.7  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.65 
 
 
1666 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
946 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43 
 
 
981 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  37.06 
 
 
940 aa  71.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 
981 aa  67.8  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 
918 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 
431 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  34.07 
 
 
862 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  43.62 
 
 
1052 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  40.2 
 
 
963 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 
959 aa  66.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  53.85 
 
 
758 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  50 
 
 
963 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 
872 aa  65.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 
960 aa  65.1  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  32.6 
 
 
541 aa  65.1  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
973 aa  64.7  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 
953 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.68 
 
 
947 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
950 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
236 aa  63.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 
680 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 
943 aa  63.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>