More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4815 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 866 aa  1692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 895 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  39.04 
 
 		 872 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 864 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 881 aa  360  8e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  33.56 
 
 		 862 aa  298  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  34.01 
 
 		 867 aa  279  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 872 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 973 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 		 992 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 983 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  32.48 
 
 		 1006 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.06 
 
 		 982 aa  105  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  32.65 
 
 		 937 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  33.25 
 
 		 957 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  33.23 
 
 		 916 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  33.14 
 
 		 1071 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.14 
 
 		 1005 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 959 aa  98.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 1118 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 723 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.76 
 
 		 713 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 970 aa  92  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.52 
 
 		 1114 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 905 aa  89.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.91 
 
 		 1034 aa  90.1  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  31.08 
 
 		 963 aa  89.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  31.52 
 
 		 1090 aa  87.8  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.49 
 
 		 1123 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 		 967 aa  86.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 1015 aa  85.5  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 967 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.26 
 
 		 1054 aa  85.1  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.42 
 
 		 1020 aa  84.7  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  32.8 
 
 		 1121 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.05 
 
 		 1403 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  30.54 
 
 		 1353 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.96 
 
 		 1029 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.07 
 
 		 1150 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.07 
 
 		 998 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.46 
 
 		 1051 aa  78.2  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.02 
 
 		 1029 aa  77  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.99 
 
 		 993 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 		 1105 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  32.39 
 
 		 1036 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.7 
 
 		 1089 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  31.68 
 
 		 963 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 1141 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 1141 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  34.44 
 
 		 1118 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.2 
 
 		 940 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  29.34 
 
 		 1123 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 		 973 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.91 
 
 		 1175 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  20.85 
 
 		 1147 aa  72  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 1141 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 1193 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.71 
 
 		 1075 aa  71.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.12 
 
 		 1055 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.33 
 
 		 1291 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 		 947 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 1116 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.3 
 
 		 1067 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 960 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.92 
 
 		 1422 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.88 
 
 		 1666 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.57 
 
 		 1126 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 		 946 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 		 999 aa  69.3  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  44.21 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  24.07 
 
 		 1403 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.92 
 
 		 1139 aa  68.9  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  22.78 
 
 		 1934 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  44.21 
 
 		 567 aa  68.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  26.17 
 
 		 1022 aa  68.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 1192 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  31.49 
 
 		 911 aa  68.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  29.16 
 
 		 1148 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 938 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.28 
 
 		 1149 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  60.94 
 
 		 954 aa  67  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.69 
 
 		 1885 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 1084 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 		 952 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 952 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.67 
 
 		 1080 aa  67  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  27.67 
 
 		 1057 aa  66.6  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.24 
 
 		 2272 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 1190 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  20.51 
 
 		 1295 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 		 1007 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  31.27 
 
 		 914 aa  66.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 1089 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.38 
 
 		 1053 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.31 
 
 		 1132 aa  65.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.87 
 
 		 977 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 932 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 1161 aa  65.1  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>