More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5220 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
960 aa  1793    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 
998 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  39.96 
 
 
951 aa  331  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 
946 aa  324  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 
948 aa  314  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 
974 aa  298  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 
952 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  36.38 
 
 
932 aa  223  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  42.04 
 
 
947 aa  202  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 
940 aa  194  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 
943 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  41.45 
 
 
855 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 
925 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 
947 aa  119  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 
1015 aa  102  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  27.09 
 
 
943 aa  97.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
994 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 
927 aa  96.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 
900 aa  95.1  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.26 
 
 
1029 aa  92  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
921 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.53 
 
 
921 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.85 
 
 
894 aa  89.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
881 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
881 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
876 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.25 
 
 
921 aa  88.6  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  30.05 
 
 
928 aa  87.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  30 
 
 
855 aa  87  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  41.79 
 
 
189 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  30.03 
 
 
919 aa  85.5  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 
918 aa  84.7  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.53 
 
 
954 aa  84.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 
956 aa  84.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.06 
 
 
881 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  28.28 
 
 
921 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 
923 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  38.81 
 
 
893 aa  82.4  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.54 
 
 
910 aa  82.4  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 
1064 aa  82.8  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
1403 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  28.92 
 
 
1151 aa  82.4  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  35.01 
 
 
904 aa  81.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 
953 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
1000 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 
940 aa  80.1  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 
911 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  30.71 
 
 
929 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 
928 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.22 
 
 
1055 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
950 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  41.08 
 
 
910 aa  79.7  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.37 
 
 
1193 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 
967 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  43.45 
 
 
923 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  42.6 
 
 
919 aa  79  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 
1007 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.9 
 
 
1190 aa  78.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
877 aa  78.2  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  32.36 
 
 
927 aa  78.2  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  27.81 
 
 
929 aa  77.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.17 
 
 
1146 aa  77.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.18 
 
 
1006 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.83 
 
 
919 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 
913 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.61 
 
 
723 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
889 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 
1005 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 
1104 aa  76.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  41.3 
 
 
908 aa  75.5  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  30.11 
 
 
955 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 
903 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.35 
 
 
1118 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 
920 aa  74.3  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 
931 aa  74.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.93 
 
 
995 aa  74.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  41.94 
 
 
923 aa  73.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.4 
 
 
1013 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
1105 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.95 
 
 
879 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
1227 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  27.15 
 
 
953 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  30.18 
 
 
1139 aa  72  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  37.78 
 
 
940 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  43.88 
 
 
1074 aa  72  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  26.92 
 
 
900 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
919 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  28.14 
 
 
919 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 
927 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.14 
 
 
919 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.51 
 
 
713 aa  71.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  29.04 
 
 
758 aa  71.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.4 
 
 
1147 aa  70.5  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 
938 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.5 
 
 
977 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.14 
 
 
1122 aa  70.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  40.91 
 
 
930 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 
916 aa  68.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.03 
 
 
922 aa  68.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 
941 aa  68.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>