More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0324 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 938 aa  1803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 952 aa  289  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 952 aa  289  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 		 1022 aa  171  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.49 
 
 		 1054 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  33.43 
 
 		 1132 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.7 
 
 		 1029 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1141 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1141 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1141 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  27.09 
 
 		 1123 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.4 
 
 		 1071 aa  102  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 983 aa  100  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 1198 aa  99.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.79 
 
 		 1006 aa  99.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.3 
 
 		 1114 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  28.3 
 
 		 1053 aa  99  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 1148 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.1 
 
 		 1150 aa  95.9  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 954 aa  95.5  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.66 
 
 		 1175 aa  94.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 1013 aa  94.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  31.43 
 
 		 1051 aa  94.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  28.32 
 
 		 1264 aa  87.8  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  26.52 
 
 		 1123 aa  86.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 966 aa  85.9  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 992 aa  85.5  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.55 
 
 		 1121 aa  85.5  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.05 
 
 		 998 aa  84.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 973 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 1141 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  31.56 
 
 		 872 aa  82.4  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  30.15 
 
 		 916 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 1118 aa  81.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 1036 aa  81.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.49 
 
 		 1075 aa  81.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 1007 aa  80.9  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 1161 aa  81.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.8 
 
 		 1126 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 900 aa  79.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  31.52 
 
 		 1118 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 959 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.11 
 
 		 217 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.74 
 
 		 1141 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 		 1139 aa  74.7  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  27.83 
 
 		 1833 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 1015 aa  74.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.63 
 
 		 1685 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  23.58 
 
 		 1148 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  23.15 
 
 		 1134 aa  72.4  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 1020 aa  72  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.42 
 
 		 1685 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.93 
 
 		 1055 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  30.26 
 
 		 955 aa  71.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  45.56 
 
 		 216 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 		 1908 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 		 953 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.52 
 
 		 1029 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 919 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 967 aa  69.3  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.34 
 
 		 928 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.68 
 
 		 922 aa  69.3  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.81 
 
 		 1797 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 1151 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  27.57 
 
 		 1090 aa  68.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.12 
 
 		 1149 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  33.8 
 
 		 943 aa  68.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  26.22 
 
 		 2051 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  23.92 
 
 		 1271 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 237 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 213 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  53.57 
 
 		 231 aa  67.4  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.88 
 
 		 1105 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.74 
 
 		 2303 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 228 aa  67  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 881 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 723 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  51.79 
 
 		 228 aa  66.6  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 970 aa  66.6  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.44 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  30.99 
 
 		 891 aa  66.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.29 
 
 		 1183 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  25.69 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.68 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.65 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.35 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  53.57 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  53.7 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 1116 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 1744 aa  64.7  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  23.25 
 
 		 1123 aa  64.7  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>