More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3369 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 872 aa  1657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 895 aa  307  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 872 aa  301  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 862 aa  293  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 864 aa  270  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 881 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 867 aa  228  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4815  transcriptional regulator, LuxR family  33.37 
 
 		 866 aa  207  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.636863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 992 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  35.76 
 
 		 1071 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.01 
 
 		 967 aa  98.2  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.88 
 
 		 1090 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.61 
 
 		 1029 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 983 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 1193 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.23 
 
 		 1150 aa  87.4  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.52 
 
 		 1114 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.62 
 
 		 1118 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 1190 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.01 
 
 		 913 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.7 
 
 		 713 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.87 
 
 		 954 aa  82.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  31.37 
 
 		 1123 aa  82  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.08 
 
 		 1075 aa  81.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.14 
 
 		 1080 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 940 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.93 
 
 		 1006 aa  78.2  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 905 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 1022 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  33.86 
 
 		 1121 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  32.64 
 
 		 1833 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 		 938 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 876 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.56 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.56 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  21.63 
 
 		 1057 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  30.7 
 
 		 884 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  28.29 
 
 		 929 aa  72  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.17 
 
 		 1081 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.4 
 
 		 1054 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 927 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.28 
 
 		 1663 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 		 1050 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.81 
 
 		 1050 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  25.56 
 
 		 1668 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 1198 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 948 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  30.59 
 
 		 1132 aa  69.7  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  27.82 
 
 		 970 aa  69.3  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  31.61 
 
 		 901 aa  69.3  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  29.6 
 
 		 1036 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  23.98 
 
 		 1105 aa  67.8  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.45 
 
 		 1055 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  30.75 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 		 562 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.62 
 
 		 916 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  32.1 
 
 		 892 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 960 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  27.7 
 
 		 1051 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  29.53 
 
 		 963 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.02 
 
 		 1712 aa  65.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.07 
 
 		 982 aa  65.1  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 959 aa  64.7  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 1118 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.65 
 
 		 1122 aa  64.3  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.26 
 
 		 1123 aa  64.3  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  21.77 
 
 		 1908 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.96 
 
 		 1794 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  23.71 
 
 		 1271 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 932 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 1151 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.07 
 
 		 1034 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.15 
 
 		 1666 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 1141 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 1141 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.84 
 
 		 923 aa  62  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 		 1402 aa  61.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.04 
 
 		 1141 aa  61.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 786 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.16 
 
 		 1788 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 894 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  27.96 
 
 		 922 aa  60.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 368 aa  60.1  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.91 
 
 		 1146 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.09 
 
 		 1780 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.67 
 
 		 1822 aa  60.1  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  34.66 
 
 		 973 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  49.43 
 
 		 937 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 967 aa  59.3  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  30.4 
 
 		 1084 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  38.14 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 1141 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 1192 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  38.14 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  28.22 
 
 		 919 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.03 
 
 		 1809 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  31.15 
 
 		 930 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>