More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9261 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  46.62 
 
 		 928 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  100 
 
 		 884 aa  1683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  47.4 
 
 		 909 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  46.75 
 
 		 884 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  43.22 
 
 		 919 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.78 
 
 		 946 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  39.89 
 
 		 927 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 928 aa  386  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.17 
 
 		 928 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 911 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  41.37 
 
 		 913 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.33 
 
 		 938 aa  365  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 		 925 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  36.83 
 
 		 930 aa  356  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  40.02 
 
 		 892 aa  344  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 923 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  36.6 
 
 		 913 aa  334  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 903 aa  332  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  36.45 
 
 		 929 aa  326  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 879 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 995 aa  317  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 910 aa  312  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 936 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 919 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 889 aa  281  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  46.92 
 
 		 940 aa  251  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 937 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  47.68 
 
 		 937 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  47.43 
 
 		 937 aa  243  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 950 aa  239  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 918 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  47.99 
 
 		 905 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.55 
 
 		 923 aa  228  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  42.58 
 
 		 922 aa  221  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 927 aa  220  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  43.49 
 
 		 920 aa  217  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 894 aa  207  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  40.73 
 
 		 934 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  38.51 
 
 		 953 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40.28 
 
 		 955 aa  193  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  40.22 
 
 		 961 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.58 
 
 		 916 aa  181  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  50.23 
 
 		 240 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 940 aa  174  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  34.43 
 
 		 917 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  43.21 
 
 		 1064 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.96 
 
 		 923 aa  165  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 835 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 915 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 929 aa  141  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  28.12 
 
 		 921 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 913 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.39 
 
 		 977 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  35.65 
 
 		 921 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 921 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  35.65 
 
 		 921 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 904 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 923 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 916 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  42.56 
 
 		 929 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 919 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  35.95 
 
 		 919 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  35.34 
 
 		 919 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  30.79 
 
 		 919 aa  98.2  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  33.81 
 
 		 900 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 881 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 881 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 1000 aa  92.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 876 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 959 aa  90.9  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 910 aa  88.6  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 967 aa  88.2  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 894 aa  87.8  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 		 983 aa  84.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  42.76 
 
 		 932 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.05 
 
 		 992 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 189 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 959 aa  82.8  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 953 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  40.34 
 
 		 893 aa  82  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 		 897 aa  81.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 997 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 1151 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 998 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 973 aa  75.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 946 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 		 1084 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.75 
 
 		 998 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.99 
 
 		 947 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  31.55 
 
 		 940 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 947 aa  68.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 882 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  48.78 
 
 		 1085 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 927 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 		 867 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  55.7 
 
 		 959 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 951 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.25 
 
 		 1006 aa  66.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 1085 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>