More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3188 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 368 aa  721    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 374 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  30.71 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  33.14 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  36.78 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  27.61 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  31.29 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  34.74 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 151 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  23.69 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  53.85 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  38.46 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 486 aa  62.8  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  47.62 
 
 		 758 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  54 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  31.72 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 550 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 872 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.45 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3754  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00290124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0108  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  48.15 
 
 		 917 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  51.92 
 
 		 893 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2686  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 178 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  53.7 
 
 		 204 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.28 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 227 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 959 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0167  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.165739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 76 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  56.6 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  56.86 
 
 		 937 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1008  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  0.0679507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  50.82 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  48.28 
 
 		 839 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 937 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  56.86 
 
 		 937 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.37 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0520  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.1412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 894 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3022  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.64 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.25 
 
 		 923 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06810  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.4 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 191 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 1000 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.28 
 
 		 213 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>