More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1243 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 550 aa  1130    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 556 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 905 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  61.82 
 
 		 905 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  60 
 
 		 905 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  58.93 
 
 		 905 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  53.23 
 
 		 911 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 216 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  58.93 
 
 		 914 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.67 
 
 		 213 aa  72  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  53.23 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 910 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  58.49 
 
 		 920 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 211 aa  70.1  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 214 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  32.67 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  60 
 
 		 906 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  56.86 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  60 
 
 		 906 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  54.39 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  54.55 
 
 		 868 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 956 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  50.77 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 1084 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 213 aa  67  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 210 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 220 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 216 aa  67  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 217 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 237 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 222 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 204 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  47.06 
 
 		 887 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  44.62 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  49.23 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  53.7 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  56.6 
 
 		 827 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  52 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 119 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1706  transcriptional regulator  56.6 
 
 		 827 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.28 
 
 		 226 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 217 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 232 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  52.63 
 
 		 917 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 238 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.21 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.84 
 
 		 850 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 244 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 220 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2537  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>