More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4422 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  88.95 
 
 
905 aa  1571    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  73.27 
 
 
910 aa  1248    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  66.3 
 
 
906 aa  1124    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  88.73 
 
 
905 aa  1570    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  74.62 
 
 
920 aa  1284    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 
905 aa  1786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  76.51 
 
 
911 aa  1353    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  66.3 
 
 
906 aa  1118    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  67.54 
 
 
914 aa  1158    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  89.94 
 
 
905 aa  1587    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  35.81 
 
 
868 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1706  transcriptional regulator  36.53 
 
 
827 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  35.99 
 
 
827 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.85 
 
 
850 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.97 
 
 
1021 aa  283  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.72 
 
 
910 aa  262  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.05 
 
 
1003 aa  240  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  28.82 
 
 
916 aa  237  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.81 
 
 
867 aa  232  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  29.2 
 
 
891 aa  231  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.56 
 
 
913 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  29.39 
 
 
887 aa  221  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.25 
 
 
876 aa  221  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  28.35 
 
 
947 aa  221  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.73 
 
 
901 aa  221  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.76 
 
 
897 aa  220  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 
907 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.6 
 
 
1019 aa  217  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  27.43 
 
 
907 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  34.04 
 
 
907 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.12 
 
 
917 aa  205  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  31 
 
 
900 aa  201  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.74 
 
 
914 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.85 
 
 
880 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.89 
 
 
877 aa  196  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.17 
 
 
870 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.86 
 
 
766 aa  187  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.79 
 
 
904 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  26.14 
 
 
904 aa  186  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  33.89 
 
 
1110 aa  183  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  27.31 
 
 
824 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  25.08 
 
 
901 aa  180  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  32.95 
 
 
878 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  25.53 
 
 
903 aa  177  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  25.53 
 
 
903 aa  177  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
921 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.32 
 
 
921 aa  175  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  31.6 
 
 
904 aa  170  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.7 
 
 
902 aa  170  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.24 
 
 
922 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.69 
 
 
899 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.18 
 
 
930 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.89 
 
 
758 aa  161  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  29.57 
 
 
896 aa  161  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  28.28 
 
 
914 aa  161  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  26.11 
 
 
901 aa  160  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
947 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.69 
 
 
894 aa  159  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  30.97 
 
 
924 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  27.91 
 
 
901 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  27.91 
 
 
901 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  27.91 
 
 
902 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  27.91 
 
 
901 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  27.91 
 
 
901 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.55 
 
 
901 aa  158  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.55 
 
 
901 aa  157  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.55 
 
 
901 aa  157  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.55 
 
 
901 aa  157  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.55 
 
 
901 aa  157  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.55 
 
 
901 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  27.36 
 
 
901 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  27.36 
 
 
901 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.75 
 
 
921 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.75 
 
 
921 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.75 
 
 
921 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  29.98 
 
 
914 aa  154  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  29.7 
 
 
913 aa  152  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.18 
 
 
933 aa  152  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  32.1 
 
 
749 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.73 
 
 
889 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.77 
 
 
896 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  32.54 
 
 
732 aa  149  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  34.68 
 
 
911 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.77 
 
 
905 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  32.7 
 
 
901 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  31.61 
 
 
894 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  25.88 
 
 
902 aa  145  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  30.89 
 
 
1097 aa  144  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.37 
 
 
924 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  27.56 
 
 
913 aa  141  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.18 
 
 
860 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.96 
 
 
896 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.06 
 
 
932 aa  137  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  31.85 
 
 
1204 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.44 
 
 
900 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  31.05 
 
 
717 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 
955 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.9 
 
 
897 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29 
 
 
935 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.69 
 
 
907 aa  129  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>