More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  65.86 
 
 		 905 aa  1111    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  67.28 
 
 		 914 aa  1129    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  63.34 
 
 		 910 aa  1069    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  63.52 
 
 		 920 aa  1075    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  66.3 
 
 		 905 aa  1101    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  64.07 
 
 		 911 aa  1104    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  96.8 
 
 		 906 aa  1734    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  65.97 
 
 		 905 aa  1113    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 906 aa  1785    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  66.3 
 
 		 905 aa  1118    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  37.92 
 
 		 868 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19850  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 827 aa  340  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.326832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1706  transcriptional regulator  37.67 
 
 		 827 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.3 
 
 		 850 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.15 
 
 		 1021 aa  298  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.93 
 
 		 910 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  24.75 
 
 		 887 aa  251  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  28.69 
 
 		 916 aa  249  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.93 
 
 		 901 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.46 
 
 		 1019 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.52 
 
 		 867 aa  236  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.01 
 
 		 876 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 921 aa  224  6e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.38 
 
 		 913 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  28.54 
 
 		 891 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.47 
 
 		 897 aa  221  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.63 
 
 		 917 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 924 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  31.23 
 
 		 900 aa  216  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.26 
 
 		 877 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 901 aa  210  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.26 
 
 		 880 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.19 
 
 		 914 aa  205  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  28.46 
 
 		 878 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.96 
 
 		 947 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.57 
 
 		 1003 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  28.2 
 
 		 824 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.42 
 
 		 894 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  24.48 
 
 		 901 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  33.2 
 
 		 904 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  32.8 
 
 		 896 aa  189  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  33.33 
 
 		 1110 aa  188  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.95 
 
 		 896 aa  188  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  33.26 
 
 		 907 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.56 
 
 		 899 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.74 
 
 		 902 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.34 
 
 		 758 aa  179  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  31.57 
 
 		 907 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 907 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  23.43 
 
 		 902 aa  174  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.8 
 
 		 766 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  27.48 
 
 		 914 aa  172  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.1 
 
 		 860 aa  165  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  31.89 
 
 		 1097 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.47 
 
 		 933 aa  161  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  24.15 
 
 		 904 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.76 
 
 		 935 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.8 
 
 		 905 aa  157  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 914 aa  156  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.18 
 
 		 889 aa  154  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.48 
 
 		 749 aa  149  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.23 
 
 		 896 aa  148  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  31.06 
 
 		 960 aa  146  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  29.86 
 
 		 913 aa  146  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  32.03 
 
 		 732 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  22.48 
 
 		 921 aa  146  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  29.21 
 
 		 913 aa  145  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  25.65 
 
 		 901 aa  145  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  34.96 
 
 		 911 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  26.1 
 
 		 901 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  26.1 
 
 		 902 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  26.1 
 
 		 901 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  26.1 
 
 		 901 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  26.1 
 
 		 901 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.23 
 
 		 922 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  25.89 
 
 		 901 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  24.78 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.89 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  25.89 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  25.89 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  24.78 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  25.89 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  25.89 
 
 		 901 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 		 903 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  25.56 
 
 		 903 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.79 
 
 		 930 aa  138  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 947 aa  138  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30 
 
 		 947 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.73 
 
 		 930 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 904 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.35 
 
 		 884 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  29.59 
 
 		 1111 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.53 
 
 		 921 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.24 
 
 		 932 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.53 
 
 		 921 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.53 
 
 		 921 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  27.37 
 
 		 894 aa  126  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  31.2 
 
 		 1204 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  30.56 
 
 		 919 aa  125  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  29.91 
 
 		 1336 aa  124  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>